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1	633630	633630	T	C	62.74	PASS	ENSG00000240409	ncRNA_exonic	ENST00000467115	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	633714	633714	A	G	112.9	PASS	ENSG00000230021,ENSG00000240409,ENSG00000248527	ncRNA_exonic	ENST00000467115;ENST00000514057	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.58;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:141,15,0
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1	634244	634244	T	C	56.74	PASS	ENSG00000248527	ncRNA_exonic	ENST00000514057	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	801143	801143	T	C	107.28	PASS	ENSG00000230092	ncRNA_exonic	ENST00000447500	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=23.54;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
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1	826893	826893	G	A	362.77	PASS	ENSG00000225880,ENSG00000228794	ncRNA_exonic	ENST00000473798;ENST00000623808	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.98;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:391,33,0
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1	827212	827212	C	G	107.28	SnpCluster	ENSG00000225880	ncRNA_exonic	ENST00000473798	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.04;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	827221	827221	T	C	127.03	SnpCluster	ENSG00000225880	ncRNA_exonic	ENST00000473798	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
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1	1714797	1714797	C	T	47.74	PASS	ENSG00000268575	ncRNA_intronic	ENST00000598846	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=23.87;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
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1	1732685	1732685	T	C	571.77	PASS	ENSG00000227775	ncRNA_exonic	ENST00000424604	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.51;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:600,48,0
1	1733036	1733036	T	C	46.77	PASS	ENSG00000215790,ENSG00000227775,ENSG00000268575	ncRNA_intronic	ENST00000424604;ENST00000577672;ENST00000598846	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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1	1733356	1733356	T	C	43.77	PASS	ENSG00000215790,ENSG00000227775,ENSG00000268575	ncRNA_intronic	ENST00000424604;ENST00000577672;ENST00000598846	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
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1	1735176	1735176	C	T	141.77	PASS	ENSG00000268575,ENSG00000227775,ENSG00000215790	ncRNA_intronic	ENST00000424604;ENST00000577672;ENST00000598846	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.765;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:74:170,0,74
1	1735370	1735370	G	A	258.77	PASS	ENSG00000268575	ncRNA_exonic	ENST00000598846	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.51;ReadPosRankSum=-1.28;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,13:47:99:287,0,1199
1	1735814	1735814	T	C	864.77	PASS	ENSG00000227775,ENSG00000268575,ENSG00000215790	ncRNA_exonic;splicing	ENST00000598846;ENST00000424604;ENST00000577672	ENST00000424604:exon2:c.292-3T>C;ENST00000577672:exon2:c.253-3T>C	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:893,69,0
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1	16497904	16497904	T	C	43.77	PASS	ENSG00000080947	ncRNA_intronic	ENST00000589964;ENST00000590118	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:37:72,0,37
1	16515473	16515473	T	G	111.77	PASS	ENSG00000261135	ncRNA_exonic	ENST00000562878	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.42;ReadPosRankSum=0;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,182
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1	16534966	16534966	G	T	24.78	PASS	ENSG00000233421	ncRNA_exonic	ENST00000415386	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,235
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1	16535150	16535150	A	C	59.74	PASS	ENSG00000233421	ncRNA_exonic	ENST00000415386	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
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1	16535966	16535966	T	A	195.77	PASS	ENSG00000233421	ncRNA_exonic	ENST00000614408	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.643;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:224,0,342
1	16536007	16536007	A	G	198.77	PASS	ENSG00000233421	ncRNA_exonic	ENST00000614408	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.09;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:227,0,134
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1	16559066	16559066	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000438396;ENST00000430580	dist=6535;dist=3253	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	16574684	16574684	G	T	77.77	QD	ENSG00000219481	exonic	ENST00000430580;ENST00000432949	.	missense SNV	ENSG00000219481:ENST00000430580:exon21:c.C2201A:p.P734Q,ENSG00000219481:ENST00000432949:exon21:c.C2201A:p.P734Q	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,7:62:99:106,0,1804
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1	16622580	16622580	T	C	197.77	PASS	ENSG00000282056	ncRNA_intronic	ENST00000412962	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.8;ReadPosRankSum=1.669;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,9:52:99:226,0,1555
1	16622683	16622683	T	C	90.77	QD	ENSG00000282056	ncRNA_intronic	ENST00000412962	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=11.342;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.46;SOR=2.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,9:63:99:119,0,1688
1	16622717	16622717	C	T	262.77	PASS	ENSG00000282056	ncRNA_intronic	ENST00000412962	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.309	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,11:56:99:291,0,1470
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1	16645799	16645799	T	C	28.77	PASS	ENSG00000186301	ncRNA_intronic	ENST00000457982	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.2;ReadPosRankSum=0.812;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:57:57,0,216
1	16645994	16645994	C	A	40.77	PASS	ENSG00000186301	ncRNA_intronic	ENST00000457982	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=0;SOR=2.245	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:69,0,61
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1	16650154	16650154	C	T	227.77	SnpCluster	ENSG00000186301	ncRNA_exonic	ENST00000457982	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=14.474;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.99;SOR=2.8	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:256,0,674
1	16650184	16650184	G	A	561.77	SnpCluster	ENSG00000186301	ncRNA_exonic	ENST00000457982	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=12.916;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,16:26:99:590,0,372
1	16650186	16650186	G	T	264.77	SnpCluster	ENSG00000186301	ncRNA_exonic	ENST00000457982	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=12.916;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.87;SOR=2.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:293,0,642
1	16651238	16651238	G	A	56.74	PASS	.	downstream	ENST00000457982	dist=949	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	16651536	16651536	C	A	46.77	PASS	.	intergenic	ENST00000457982;ENST00000633763	dist=1247;dist=5343	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
1	16652499	16652499	C	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000457982;ENST00000633763	dist=2210;dist=4380	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
1	16680437	16680437	C	G	97.28	PASS	.	upstream;downstream	ENST00000584111;ENST00000624828	dist=660;dist=660	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	16680574	16680574	A	G	139.03	PASS	.	upstream;downstream	ENST00000584111;ENST00000624828	dist=523;dist=523	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
1	16683309	16683309	T	C	93.77	PASS	ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.7;ReadPosRankSum=2.968;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:122,0,192
1	16683526	16683526	A	G	37.77	QD	ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=11.72;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.02;ReadPosRankSum=1.513;SOR=3.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,5:37:66:66,0,892
1	16683936	16683936	A	G	52.77	QD	ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.09;ClippingRankSum=0;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=5.866;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=0.36;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=1.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,14:145:81:81,0,4096
1	16684120	16684120	C	T	331.77	PASS	ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.314;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.375;SOR=1.15	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,16:103:99:360,0,2891
1	16684498	16684498	G	A	723.77	PASS	ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000624828	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.45;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:752,54,0
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1	16686719	16686719	T	C	4864.77	PASS	ENSG00000280114	ncRNA_exonic	ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=26.474;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.61;SOR=2.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,133:179:99:4893,0,1235
1	16687665	16687665	A	G	64.77	QD	ENSG00000268869,ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000414828;ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=9.885;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=0.6;ReadPosRankSum=2.99;SOR=2.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,10:108:93:93,0,3367
1	16687721	16687721	C	T	58.77	QD	ENSG00000268869,ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000414828;ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=10.605;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=0.64;ReadPosRankSum=-2.744;SOR=2.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,9:92:87:87,0,2837
1	16688081	16688081	G	A	213.77	PASS	ENSG00000268869,ENSG00000280114	ncRNA_intronic	ENST00000414828;ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.453;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,10:48:99:242,0,1300
1	16688140	16688140	T	C	1107.77	PASS	ENSG00000280114,ENSG00000268869	ncRNA_intronic	ENST00000414828;ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.02;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,31:41:99:1136,0,258
1	16688177	16688177	T	C	1036.77	PASS	ENSG00000280114,ENSG00000268869	ncRNA_intronic	ENST00000414828;ENST00000624828	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.34;SOR=1.145	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,31:65:99:1065,0,1088
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1	16692625	16692625	C	T	356.77	PASS	ENSG00000268869	ncRNA_intronic	ENST00000270691	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.86;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:385,30,0
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1	16699509	16699509	C	G	492.77	PASS	ENSG00000268869	ncRNA_exonic	ENST00000270691	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.7;ReadPosRankSum=0.251;SOR=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,19:64:99:521,0,1575
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1	16735719	16735719	C	G	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000624031;ENST00000633433	dist=1258;dist=4219	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	16740013	16740013	C	A	21.77	PASS	ENSG00000282740	ncRNA_exonic	ENST00000633433	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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1	16757157	16757157	C	T	229.8	PASS	ENSG00000058453,ENSG00000186715	ncRNA_exonic	ENST00000455405;ENST00000624762	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.83;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:258,21,0
1	16757281	16757281	C	A	46.77	PASS	ENSG00000058453,ENSG00000186715	ncRNA_exonic	ENST00000442552;ENST00000455405;ENST00000624762	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
1	16757342	16757342	T	C	66.77	PASS	ENSG00000186715,ENSG00000058453	ncRNA_exonic	ENST00000442552;ENST00000455405;ENST00000624762	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:95:95,0,262
1	16757377	16757377	G	A	150.77	PASS	ENSG00000058453,ENSG00000186715	ncRNA_exonic	ENST00000442552;ENST00000455405;ENST00000624762	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.674;SOR=3.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:179,0,179
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1	16757434	16757434	A	C	46.77	PASS	ENSG00000186715,ENSG00000058453	ncRNA_intronic	ENST00000442552;ENST00000455405;ENST00000624762	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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1	16758917	16758917	C	T	224.77	PASS	ENSG00000186715,ENSG00000058453	ncRNA_exonic	ENST00000442552;ENST00000624762	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.97;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:56:253,0,56
1	16758932	16758932	T	C	315.78	PASS	ENSG00000058453,ENSG00000186715	ncRNA_exonic	ENST00000442552;ENST00000624762	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.13;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:344,24,0
1	16759047	16759047	G	A	224.77	PASS	ENSG00000058453,ENSG00000186715	ncRNA_intronic	ENST00000442552;ENST00000624762	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:51:253,0,51
1	16759069	16759069	A	G	180.9	PASS	ENSG00000058453,ENSG00000186715	ncRNA_exonic	ENST00000442552;ENST00000624762	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=38.23;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
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1	16866505	16866505	T	C	56.74	PASS	ENSG00000058453	intergenic	ENST00000414128;ENST00000438002	dist=7221;dist=4440	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	16869892	16869892	C	T	279.77	PASS	ENSG00000058453	intergenic	ENST00000414128;ENST00000438002	dist=10608;dist=1053	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:308,0,510
1	16870124	16870124	C	G	479.77	PASS	ENSG00000228549	upstream	ENST00000438002	dist=821	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.7;ReadPosRankSum=-0.27;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,20:41:99:508,0,691
1	16870774	16870774	C	G	153.77	PASS	ENSG00000058453	upstream	ENST00000438002;ENST00000619677	dist=171	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.953;SOR=0.84	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,8:36:99:182,0,941
1	16870862	16870862	G	A	233.77	PASS	ENSG00000058453	upstream	ENST00000438002;ENST00000619677	dist=83	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,9:38:99:262,0,949
1	16871068	16871068	G	T	423.77	PASS	ENSG00000228549	ncRNA_exonic	ENST00000438002	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.7;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.26	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:452,0,1128
1	16871075	16871075	C	T	426.77	PASS	ENSG00000228549	ncRNA_exonic	ENST00000438002	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.34	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:455,0,1091
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1	22043928	22043928	A	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000416769;ENST00000400259	dist=12705;dist=8699	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
1	22053519	22053519	T	C	97.28	PASS	ENSG00000070831	intronic	ENST00000315554;ENST00000344548;ENST00000400259;ENST00000411827	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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1	22061032	22061032	A	G	105.03	PASS	ENSG00000230068	ncRNA_intronic	ENST00000431803	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
1	22063579	22063579	G	T	63.28	PASS	ENSG00000230068	ncRNA_intronic	ENST00000431803	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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1	22092942	22092942	C	A	33.77	QD	ENSG00000070831	UTR3	ENST00000344548	ENST00000344548:c.*1425C>A	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.09;ReadPosRankSum=1.135;SOR=0.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,4:31:62:62,0,1476
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1	22114432	22114432	T	C	105.03	PASS	.	intergenic	ENST00000606754;ENST00000290167	dist=13072;dist=2873	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
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1	22893000	22893000	T	C	624.77	PASS	ENSG00000133216	exonic	ENST00000374627;ENST00000374630;ENST00000374632;ENST00000400191	.	synonymous SNV	ENSG00000133216:ENST00000374627:exon7:c.T1530C:p.G510G,ENSG00000133216:ENST00000374630:exon7:c.T1545C:p.G515G,ENSG00000133216:ENST00000374632:exon7:c.T1545C:p.G515G,ENSG00000133216:ENST00000400191:exon7:c.T1545C:p.G515G	AC=2;AF=1;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.24;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:653,60,0
1	23048615	23048615	C	T	21.77	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
1	23056236	23056236	A	G	56.74	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	23057211	23057211	G	A	263.8	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.78;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
1	23063806	23063806	T	A	56.74	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	23064151	23064151	A	G	105.03	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
1	23065282	23065282	G	T	263.8	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.11;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
1	23069462	23069462	A	C	97.28	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	23069781	23069781	C	T	222.84	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=37.58;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
1	23071572	23071572	C	T	56.74	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	23074466	23074466	A	G	56.77	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:32:85,0,32
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1	23076872	23076872	A	G	42.77	PASS	ENSG00000240553	ncRNA_intronic	ENST00000427154	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
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1	30833639	30833639	T	C	514.77	PASS	ENSG00000223382	ncRNA_exonic	ENST00000430320;ENST00000438790	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:543,39,0
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1	42974805	42974805	T	G	84.77	PASS	ENSG00000227533	ncRNA_exonic	ENST00000416689	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
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1	75635337	75635337	A	C	421.77	PASS	.	intergenic	ENST00000370859;ENST00000446582	dist=24221;dist=6009	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.25;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
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1	119161682	119161682	A	G	76.77	SnpCluster	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.6;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:99:105,0,243
1	119161688	119161688	A	G	24.78	SnpCluster	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,304
1	119161697	119161697	A	T	270.8	SnpCluster	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.7;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
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1	119164261	119164261	A	G	46.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
1	119165266	119165266	G	A	56.74	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	119173776	119173776	T	G	149.03	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.14;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	119173781	119173781	A	G	149.03	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.59;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
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1	119177043	119177043	T	G	63.28	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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1	119177541	119177541	T	G	97.28	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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1	119178481	119178481	A	G	97.28	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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1	119179456	119179456	A	G	438.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.06;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:467,36,0
1	119179986	119179986	T	C	109.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:138,0,125
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1	119180342	119180342	C	T	176.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:205,0,288
1	119180774	119180774	C	T	184.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.358;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:213,0,187
1	119181257	119181257	T	C	207.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000413531;ENST00000418015;ENST00000440150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.652;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:236,0,378
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1	119182902	119182902	C	T	571.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_exonic	ENST00000440150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.56;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:600,48,0
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1	119247432	119247432	T	C	31.29	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000418015	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:59,9,0
1	119251788	119251788	C	T	84.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000418015	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.19;ReadPosRankSum=0;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
1	119252510	119252510	G	A	43.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000418015	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=0;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
1	119255537	119255537	C	T	378.77	PASS	ENSG00000231365	ncRNA_intronic	ENST00000418015	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.14;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:407,39,0
1	119592471	119592471	C	T	44.74	PASS	.	intergenic	ENST00000511509;ENST00000443168	dist=20404;dist=3696	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
1	119598729	119598729	C	T	56.74	PASS	ENSG00000260941	ncRNA_exonic	ENST00000562811	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	119601130	119601130	G	A	112.9	PASS	.	upstream	ENST00000434856	dist=210	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.58;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:141,15,0
1	119601400	119601400	C	T	97.28	PASS	ENSG00000198857	ncRNA_exonic	ENST00000434856	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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1	119616502	119616502	A	G	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000434856;ENST00000421812	dist=7252;dist=2920	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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1	120558655	120558655	G	T	275.77	SnpCluster	ENSG00000275131	ncRNA_intronic	ENST00000612480	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=21.66;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.478;SOR=4.61	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:304,0,511
1	120558836	120558836	C	G	114.77	PASS	ENSG00000275131	ncRNA_intronic	ENST00000612480	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.05;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.2;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:143,0,258
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1	120723956	120723956	C	G	347.78	PASS	ENSG00000278882	UTR5	ENST00000624419	ENST00000624419:c.-39716C>G	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.28;SOR=4.615	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
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1	120772428	120772428	C	T	56.74	PASS	ENSG00000278882	intronic	ENST00000624419	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	120793448	120793448	A	T	2550.77	PASS	ENSG00000278882	exonic	ENST00000624419	.	missense SNV	ENSG00000278882:ENST00000624419:exon4:c.A586T:p.T196S	AC=2;AF=1;AN=2;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.76;SOR=1.451	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2579,213,0
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1	120801272	120801272	T	G	117.77	PASS	.	intergenic	ENST00000624419;ENST00000611287	dist=7395;dist=4146	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.08;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:146,0,180
1	120801619	120801619	C	T	34.77	PASS	.	intergenic	ENST00000624419;ENST00000611287	dist=7742;dist=3799	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,118
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1	146060479	146060479	A	G	405.77	SnpCluster	ENSG00000233396	ncRNA_intronic	ENST00000457465;ENST00000611275;ENST00000619720	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.6;SOR=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
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1	147250567	147250567	G	A	71.03	PASS	ENSG00000273071	ncRNA_intronic	ENST00000606856	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=17.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:99,12,0
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1	147261765	147261765	A	T	266.77	PASS	ENSG00000278811	ncRNA_intronic	ENST00000619867	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.59;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.05;ReadPosRankSum=-1.568;SOR=0.399	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:295,0,125
1	147261907	147261907	C	T	71.77	PASS	ENSG00000278811	ncRNA_intronic	ENST00000619867	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.682;SOR=1.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:100,0,198
1	147262057	147262057	A	G	305.78	PASS	ENSG00000278811	ncRNA_intronic	ENST00000619867	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.55;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
1	147262943	147262943	A	T	162.78	PASS	ENSG00000278811	ncRNA_intronic	ENST00000619867	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.13;ReadPosRankSum=0;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:191,0,24
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1	147274585	147274585	A	G	36.77	PASS	ENSG00000278811	ncRNA_intronic	ENST00000619867	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.13;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,148
1	147274959	147274959	C	T	229.8	PASS	ENSG00000278811	ncRNA_intronic	ENST00000619867	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.83;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:258,21,0
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1	148420518	148420518	G	A	108.77	PASS	ENSG00000231551,ENSG00000274020	ncRNA_exonic	ENST00000426101;ENST00000445243	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:137,0,221
1	148420602	148420602	T	C	128.78	PASS	ENSG00000231551,ENSG00000274020	ncRNA_exonic	ENST00000426101;ENST00000445243	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.46;ReadPosRankSum=0;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:157,0,24
1	148425499	148425499	C	T	49.77	PASS	ENSG00000231551	ncRNA_exonic	ENST00000445243	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
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1	148425641	148425641	G	A	85.77	PASS	ENSG00000231551	ncRNA_exonic	ENST00000445243	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,159
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1	148426103	148426103	A	G	56.74	PASS	ENSG00000231551,ENSG00000274020	ncRNA_intronic	ENST00000426101;ENST00000445243;ENST00000622328	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	148426192	148426192	A	G	44.41	PASS	ENSG00000274020,ENSG00000231551	ncRNA_intronic	ENST00000426101;ENST00000445243;ENST00000622328	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.1;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:8:72,0,8
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1	148433807	148433807	G	A	113.77	PASS	ENSG00000274020	ncRNA_intronic	ENST00000613452;ENST00000622328	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:142,0,206
1	148434101	148434101	G	A	72.77	PASS	ENSG00000274020	ncRNA_intronic	ENST00000613452;ENST00000622328	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:101,0,30
1	148459279	148459279	G	A	249.77	PASS	ENSG00000280649	exonic	ENST00000629247	.	synonymous SNV	ENSG00000280649:ENST00000629247:exon1:c.G426A:p.Q142Q	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.35;ReadPosRankSum=-2.912;SOR=0.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:278,0,477
1	148467530	148467530	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000440862;ENST00000419275	dist=7380;dist=12294	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	151847848	151847848	T	C	305.78	PASS	ENSG00000196407	exonic	ENST00000368817	.	missense SNV	ENSG00000196407:ENST00000368817:exon5:c.A590G:p.D197G	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
1	151849527	151849527	A	C	139.03	PASS	ENSG00000234614	ncRNA_intronic	ENST00000434182	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
1	151849720	151849720	A	G	146.9	PASS	ENSG00000234614	ncRNA_intronic	ENST00000434182	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.38;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
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1	159976943	159976943	A	G	82.77	PASS	ENSG00000224259	ncRNA_exonic	ENST00000423943;ENST00000443364	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.41;SOR=0.293	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,6:31:99:111,0,910
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1	178542806	178542806	A	C	104.77	PASS	ENSG00000213057,ENSG00000240021	ncRNA_exonic	ENST00000367638;ENST00000521244	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:133,0,254
1	178543631	178543631	A	G	75.77	PASS	ENSG00000213057,ENSG00000240021	ncRNA_intronic	ENST00000367638;ENST00000521244	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,146
1	178544207	178544207	G	A	236.79	PASS	ENSG00000240021,ENSG00000213057	ncRNA_intronic	ENST00000367638;ENST00000521244	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.2;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.915;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:22:265,0,22
1	178544276	178544276	C	T	263.8	PASS	ENSG00000240021,ENSG00000213057	ncRNA_intronic	ENST00000367638;ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.29;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
1	178544760	178544760	T	G	305.78	PASS	ENSG00000240021,ENSG00000213057	ncRNA_intronic	ENST00000367638;ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.36;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
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1	178545068	178545068	C	A	257.77	PASS	ENSG00000213057,ENSG00000240021	ncRNA_intronic	ENST00000367638;ENST00000521244	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.48;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:286,0,131
1	178546000	178546000	A	T	251.8	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_intronic	ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.67;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:280,21,0
1	178546052	178546052	A	G	263.8	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_intronic	ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.88;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
1	178546177	178546177	G	A	56.74	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_intronic	ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	178546671	178546671	T	C	65.28	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_intronic	ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.76;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
1	178547766	178547766	C	T	22.79	QD	ENSG00000213057	ncRNA_exonic	ENST00000521244	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.605;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:51:51,0,521
1	178547870	178547870	G	C	435.77	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_exonic	ENST00000521244	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=29.05;ReadPosRankSum=2.797;SOR=0.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:38:464,0,38
1	178548181	178548181	C	T	448.77	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_exonic	ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.52;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:477,39,0
1	178548230	178548230	A	G	57.77	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_exonic	ENST00000521244	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.37;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=2.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:86:86,0,310
1	178548456	178548456	A	G	502.77	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_exonic	ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.52;SOR=1.112	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:531,45,0
1	178548873	178548873	A	G	85.28	PASS	ENSG00000213057	ncRNA_exonic	ENST00000521244	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
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1	178549649	178549649	G	T	313.78	PASS	.	downstream	ENST00000521244	dist=760	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.86;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
1	178550808	178550808	C	T	200.77	PASS	.	intergenic	ENST00000521244;ENST00000364477	dist=1919;dist=10105	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.61;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:63:229,0,63
1	178551442	178551442	C	A	263.8	PASS	.	intergenic	ENST00000521244;ENST00000364477	dist=2553;dist=9471	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.28;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
1	178551469	178551469	T	A	639.77	PASS	.	intergenic	ENST00000521244;ENST00000364477	dist=2580;dist=9444	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.51;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:668,48,0
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1	178725187	178725187	C	A	56.74	PASS	ENSG00000273062	ncRNA_exonic	ENST00000608517	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	178921516	178921516	A	T	32.77	FS;QD	ENSG00000116191	UTR3	ENST00000367634	ENST00000367634:c.*5157A>T	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=37.41;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.47;SOR=5.131	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:61:61,0,201
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1	179017489	179017489	T	C	196.84	PASS	.	intergenic	ENST00000367634;ENST00000440702	dist=95648;dist=8315	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.6;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:225,0,18
1	179032305	179032305	G	A	27.75	PASS	ENSG00000116199	intronic	ENST00000263733;ENST00000440702	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=13.87;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
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1	201518962	201518962	A	G	168.77	PASS	ENSG00000223396	ncRNA_exonic	ENST00000441932	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.11;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:197,0,62
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1	201519669	201519669	A	G	71.77	PASS	ENSG00000223396	ncRNA_exonic	ENST00000441932	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:100,0,727
1	201519827	201519827	A	G	81.77	PASS	ENSG00000223396	ncRNA_exonic	ENST00000441932	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:55:110,0,55
1	201520158	201520158	C	G	102.77	PASS	ENSG00000224536,ENSG00000223396,ENSG00000242150	ncRNA_exonic	ENST00000441932;ENST00000482594	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,5:26:99:131,0,799
1	201520437	201520437	C	T	48.77	QD	ENSG00000242150,ENSG00000223396,ENSG00000224536	ncRNA_exonic	ENST00000441932;ENST00000482594	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.817;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.251;SOR=1.297	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,6:35:77:77,0,956
1	201521938	201521938	A	G	25.78	PASS	ENSG00000223396,ENSG00000224536	ncRNA_intronic	ENST00000441932;ENST00000454651	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.253;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,272
1	201522012	201522012	A	G	43.77	PASS	ENSG00000223396,ENSG00000224536	ncRNA_intronic	ENST00000441932;ENST00000454651	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.29;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,205
1	201522022	201522022	A	G	43.77	PASS	ENSG00000223396,ENSG00000224536	ncRNA_intronic	ENST00000441932;ENST00000454651	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.29;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,205
1	201523198	201523198	A	G	62.74	PASS	ENSG00000224536,ENSG00000223396	ncRNA_intronic	ENST00000441932;ENST00000454651	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	201523214	201523214	A	G	62.74	PASS	ENSG00000223396,ENSG00000224536	ncRNA_intronic	ENST00000441932;ENST00000454651	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	201525821	201525821	C	G	56.74	PASS	ENSG00000224536,ENSG00000223396	ncRNA_intronic	ENST00000441932;ENST00000454651	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	201531480	201531480	A	G	30.77	PASS	ENSG00000224536	ncRNA_intronic	ENST00000454651	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,192
1	201533178	201533178	T	A	33.77	PASS	ENSG00000224536	ncRNA_intronic	ENST00000454651	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.366;SOR=2.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,188
1	201557664	201557664	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000454651;ENST00000593583	dist=24056;dist=65221	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
1	201724378	201724378	G	T	56.74	PASS	ENSG00000235121	ncRNA_exonic	ENST00000429443	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	201724634	201724634	A	C	97.28	PASS	ENSG00000235121	ncRNA_exonic	ENST00000429443	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	201724703	201724703	C	A	97.28	PASS	ENSG00000235121	ncRNA_exonic	ENST00000429443	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	201727819	201727819	G	A	21.77	PASS	ENSG00000231871,ENSG00000235121,ENSG00000134369	ncRNA_intronic	ENST00000413035;ENST00000429443	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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1	201821698	201821698	T	C	621.77	PASS	ENSG00000231871,ENSG00000134369	ncRNA_intronic	ENST00000413035;ENST00000421159;ENST00000421449	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.54;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:650,54,0
1	201822072	201822072	G	A	846.77	PASS	ENSG00000231871	ncRNA_exonic	ENST00000421159	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.31;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:875,66,0
1	201824221	201824221	C	A	159.77	PASS	ENSG00000134369,ENSG00000231871	ncRNA_intronic	ENST00000413035;ENST00000421159;ENST00000421449	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=22.82;ReadPosRankSum=0.241;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:188,0,62
1	201824312	201824312	C	G	355.77	PASS	ENSG00000134369,ENSG00000231871	ncRNA_intronic	ENST00000413035;ENST00000421159;ENST00000421449	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.4;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:384,30,0
1	201824636	201824636	G	A	114.9	PASS	ENSG00000231871,ENSG00000134369	ncRNA_intronic	ENST00000413035;ENST00000421159;ENST00000421449	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.98;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:143,15,0
1	201828568	201828568	T	C	56.74	PASS	ENSG00000231871	ncRNA_intronic	ENST00000413035;ENST00000421159;ENST00000421449	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	202001620	202001620	G	A	53.28	PASS	ENSG00000234678	ncRNA_intronic	ENST00000419190	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=17.76;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:81,9,0
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1	202010327	202010327	G	A	569.77	PASS	ENSG00000234678	ncRNA_exonic	ENST00000419190	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.92;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.9;ReadPosRankSum=-1.45;SOR=1.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,17:22:99:598,0,143
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1	202012227	202012227	G	C	400.77	PASS	ENSG00000249007	ncRNA_intronic	ENST00000504773	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=10.65;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.87;SOR=1.66	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:429,0,769
1	202012734	202012734	T	C	11333.8	PASS	ENSG00000249007,ENSG00000163435	exonic	ENST00000359651;ENST00000367283;ENST00000367284;ENST00000446188	.	synonymous SNV	ENSG00000163435:ENST00000359651:exon4:c.T573C:p.P191P,ENSG00000163435:ENST00000367283:exon5:c.T573C:p.P191P,ENSG00000163435:ENST00000367284:exon5:c.T573C:p.P191P,ENSG00000163435:ENST00000446188:exon5:c.T567C:p.P189P	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.88;ClippingRankSum=0;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.01;ReadPosRankSum=0.27;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,334:472:99:11362,0,3638
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1	202144707	202144707	T	G	389.77	PASS	ENSG00000143862	UTR5	ENST00000272217;ENST00000614750	ENST00000272217:c.-135A>C;ENST00000614750:c.-135A>C	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.83;SOR=4.804	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
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1	202169973	202169973	C	G	139.03	PASS	ENSG00000243323	ncRNA_exonic	ENST00000482597;ENST00000490225	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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1	202185238	202185238	G	A	21.77	PASS	ENSG00000243323	ncRNA_intronic	ENST00000482597;ENST00000490225	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
1	202186415	202186415	A	C	56.74	PASS	ENSG00000243323	ncRNA_exonic	ENST00000482597;ENST00000490225	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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1	206650022	206650022	T	A	1300.77	PASS	ENSG00000143479	downstream	ENST00000367106;ENST00000367108;ENST00000367109	dist=825	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,46:73:99:1329,0,773
1	206652260	206652260	T	C	1782.77	PASS	ENSG00000143479	intergenic	ENST00000367108;ENST00000294981	dist=3063;dist=32684	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.864;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,50:68:99:1811,0,514
1	206652298	206652298	A	G	1920.77	PASS	ENSG00000143479	intergenic	ENST00000367108;ENST00000294981	dist=3101;dist=32646	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=3.419;ClippingRankSum=0;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.851;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,52:70:99:1949,0,461
1	206654817	206654817	C	T	1566.77	PASS	ENSG00000143479	intergenic	ENST00000367108;ENST00000294981	dist=5620;dist=30127	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.27;ReadPosRankSum=2.164;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,50:62:99:1595,0,206
1	206682745	206682745	G	A	21.77	PASS	ENSG00000143479	intergenic	ENST00000367108;ENST00000294981	dist=33548;dist=2199	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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1	246661167	246661167	A	G	46.77	PASS	ENSG00000162852	intronic	ENST00000366513	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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1	246665108	246665108	A	G	81.77	PASS	ENSG00000162852	intronic	ENST00000366513	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=0;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:110,0,68
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1	247207676	247207676	T	C	33.77	PASS	ENSG00000227671	ncRNA_intronic	ENST00000421406;ENST00000606173;ENST00000606212;ENST00000606454	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.366;SOR=2.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,154
1	247208350	247208350	T	C	57.77	PASS	ENSG00000227671	ncRNA_intronic	ENST00000421406;ENST00000606173;ENST00000606212;ENST00000606454	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.57;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.73;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:86:86,0,298
1	247208616	247208616	T	C	72.77	PASS	ENSG00000227671	ncRNA_intronic	ENST00000421406;ENST00000606173;ENST00000606212;ENST00000606454	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.1;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,161
1	247208707	247208707	T	A	77.77	PASS	ENSG00000227671	ncRNA_intronic	ENST00000421406;ENST00000606173;ENST00000606212;ENST00000606454	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.057;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:106,0,170
1	247208861	247208861	G	T	47.77	PASS	ENSG00000227671	ncRNA_intronic	ENST00000421406;ENST00000606173;ENST00000606212;ENST00000606454	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:76,0,69
1	247209370	247209370	C	T	159.77	PASS	ENSG00000227671	ncRNA_intronic	ENST00000421406;ENST00000606173;ENST00000606212;ENST00000606454	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.469;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:188,0,139
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1	247692811	247692811	T	A	21.77	PASS	ENSG00000235749	ncRNA_intronic	ENST00000449298	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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10	5513449	5513449	T	A	56.74	PASS	.	downstream	ENST00000543008	dist=795	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5515470	5515470	G	A	42.77	PASS	ENSG00000205488	ncRNA_exonic	ENST00000543008	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
10	5516386	5516386	G	A	56.74	PASS	ENSG00000205488	ncRNA_exonic	ENST00000543008	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5521966	5521966	G	T	146.9	PASS	ENSG00000205488	ncRNA_exonic	ENST00000542093;ENST00000543008;ENST00000545372	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.38;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
10	5525403	5525403	G	A	173.77	PASS	ENSG00000178363	exonic	ENST00000315238	.	synonymous SNV	ENSG00000178363:ENST00000315238:exon1:c.G318A:p.L106L	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:202,0,284
10	5525732	5525732	G	A	139.03	PASS	ENSG00000256462	ncRNA_exonic	ENST00000442008	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
10	5545904	5545904	G	T	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000315238;ENST00000478294	dist=19133;dist=49087	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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10	5600077	5600077	G	A	31.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=3959;dist=8398	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.94;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:37:60,0,37
10	5600896	5600896	C	T	42.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=4778;dist=7579	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
10	5601008	5601008	A	G	86.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=4890;dist=7467	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=0;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:115,0,72
10	5601152	5601152	A	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=5034;dist=7323	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5601792	5601792	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=5674;dist=6683	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5601855	5601855	C	T	43.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=5737;dist=6620	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:37:72,0,37
10	5601906	5601906	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=5788;dist=6569	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5602064	5602064	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=5946;dist=6411	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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10	5604374	5604374	G	A	46.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=8256;dist=4101	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
10	5604522	5604522	C	G	129.78	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=8404;dist=3953	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:25:158,0,25
10	5606138	5606138	C	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=10020;dist=2337	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5606824	5606824	G	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=10706;dist=1651	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5607003	5607003	A	G	43.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478294;ENST00000425246	dist=10885;dist=1472	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:37:72,0,37
10	5607721	5607721	T	C	56.74	PASS	.	downstream	ENST00000425246	dist=754	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5608083	5608083	T	C	97.28	PASS	.	downstream	ENST00000425246	dist=392	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	5609800	5609800	A	G	56.74	PASS	ENSG00000231483	ncRNA_splicing	ENST00000425246	ENST00000425246:exon4:c.246-3T>C	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5610677	5610677	A	G	32.74	PASS	ENSG00000231483	ncRNA_intronic	ENST00000425246	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=16.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:60,6,0
10	5617043	5617043	T	C	41.77	PASS	ENSG00000228951	ncRNA_exonic	ENST00000427341	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:70:70,0,146
10	5617966	5617966	G	A	139.03	PASS	ENSG00000228951	ncRNA_exonic	ENST00000427341	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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10	47538624	47538624	T	C	102.77	PASS	ENSG00000251079	ncRNA_exonic	ENST00000532854	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.816;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:131,0,109
10	47538711	47538711	T	C	81.77	PASS	ENSG00000251079	ncRNA_exonic	ENST00000532854	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.842;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:34:110,0,34
10	47540879	47540879	C	G	105.77	PASS	ENSG00000251079,ENSG00000254929,ENSG00000204172	ncRNA_intronic	ENST00000431840;ENST00000450360;ENST00000532854;ENST00000605970	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.473;SOR=1.27	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:134,0,225
10	47542263	47542263	G	A	26.78	PASS	ENSG00000204172	exonic	ENST00000413193	.	missense SNV	ENSG00000204172:ENST00000413193:exon4:c.C365T:p.S122F	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:55:55,0,185
10	47558407	47558407	A	G	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000431840;ENST00000585063	dist=4893;dist=5197	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
10	47706153	47706153	G	A	57.77	PASS	ENSG00000189014	ncRNA_intronic	ENST00000323387	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:86:86,0,155
10	47708153	47708153	A	G	46.77	PASS	ENSG00000189014	ncRNA_intronic	ENST00000323387	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
10	47715747	47715747	T	A	46.77	PASS	ENSG00000189014	ncRNA_exonic	ENST00000323387	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
10	47726888	47726888	A	G	78.77	PASS	ENSG00000189014	ncRNA_exonic	ENST00000323387	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:95:107,0,95
10	47747949	47747949	T	C	76.77	PASS	.	intergenic	ENST00000323387;ENST00000623662	dist=17513;dist=2915	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:105,0,63
10	47901721	47901721	G	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000623662;ENST00000479781	dist=138129;dist=6343	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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10	47927636	47927636	G	A	44.74	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
10	47927672	47927672	T	C	56.74	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	47928934	47928934	G	A	44.74	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
10	47929004	47929004	T	C	175.9	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.82;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
10	47929102	47929102	G	A	97.28	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	47929723	47929723	A	C	97.28	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	47930356	47930356	A	T	97.28	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	47954510	47954510	A	G	85.28	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781;ENST00000613389;ENST00000618306	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
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10	47974265	47974265	G	C	21.77	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781;ENST00000613389;ENST00000618306	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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10	47989358	47989358	C	G	107.28	PASS	ENSG00000276850	ncRNA_intronic	ENST00000479781;ENST00000610809	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.54;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
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10	65623185	65623185	T	C	50.77	PASS	ENSG00000228065	ncRNA_intronic	ENST00000433152;ENST00000594054;ENST00000595269;ENST00000595737;ENST00000598092;ENST00000598902;ENST00000600848;ENST00000601389;ENST00000601888;ENST00000601926;ENST00000618687;ENST00000626101;ENST00000626907;ENST00000629716	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
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11	59109246	59109246	T	C	169.77	PASS	ENSG00000189057	intronic	ENST00000343597;ENST00000411426;ENST00000529618;ENST00000534403	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:198,0,281
11	59109247	59109247	C	G	169.77	PASS	ENSG00000189057	intronic	ENST00000343597;ENST00000411426;ENST00000529618;ENST00000534403	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:198,0,281
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11	88321178	88321178	G	C	44.74	PASS	ENSG00000109861	UTR3	ENST00000524463	ENST00000524463:c.*5255C>G	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
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11	126606405	126606405	C	T	286.77	PASS	ENSG00000257271	ncRNA_intronic	ENST00000548204	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.68;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:315,30,0
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11	126608413	126608413	T	A	347.78	PASS	ENSG00000257271	ncRNA_intronic	ENST00000548204	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
11	126608442	126608442	G	C	305.78	PASS	ENSG00000257271	ncRNA_intronic	ENST00000548204	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=35.47;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
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12	8261752	8261752	T	G	23.76	PASS	ENSG00000256589	ncRNA_intronic	ENST00000541031	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=11.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
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12	9437690	9437690	A	G	139.03	PASS	ENSG00000214826	ncRNA_intronic	ENST00000432996	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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12	9438178	9438178	G	A	570.77	PASS	ENSG00000214826	ncRNA_exonic	ENST00000432996	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=16.868;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.776;SOR=1.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,20:47:99:599,0,976
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12	19795917	19795917	G	A	21.77	PASS	ENSG00000255910	ncRNA_intronic	ENST00000535764	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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12	19843570	19843570	G	A	21.77	PASS	ENSG00000255910	ncRNA_intronic	ENST00000535764	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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12	19901034	19901034	A	T	21.77	PASS	ENSG00000255910	ncRNA_intronic	ENST00000535764	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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12	20008314	20008314	A	G	21.77	PASS	ENSG00000255910	ncRNA_intronic	ENST00000535764	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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12	20023707	20023707	A	G	56.74	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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12	20027779	20027779	T	C	21.77	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
12	20029993	20029993	A	G	44.74	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
12	20031195	20031195	C	T	55.74	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	20031534	20031534	A	T	56.74	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	20033037	20033037	A	T	56.74	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	20037807	20037807	T	C	46.77	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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12	20087391	20087391	C	T	21.77	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
12	20093394	20093394	C	T	59.74	PASS	ENSG00000256287	ncRNA_intronic	ENST00000536666	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
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12	20120971	20120971	C	T	21.77	PASS	.	downstream	ENST00000543778	dist=9	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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12	20135974	20135974	G	T	161.77	PASS	.	intergenic	ENST00000543778;ENST00000535755	dist=6161;dist=225758	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:190,0,139
12	20136855	20136855	G	A	57.78	PASS	.	intergenic	ENST00000543778;ENST00000535755	dist=7042;dist=224877	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.56;ReadPosRankSum=0;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:86,0,27
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12	20363424	20363424	A	G	105.03	PASS	ENSG00000256879	ncRNA_intronic	ENST00000535755	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
12	20365091	20365091	T	G	263.8	PASS	ENSG00000256879	ncRNA_intronic	ENST00000535755	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.11;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
12	20366347	20366347	T	A	75.77	PASS	ENSG00000256879	ncRNA_intronic	ENST00000535755	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,134
12	20368720	20368720	C	A	436.77	PASS	ENSG00000256879	ncRNA_intronic	ENST00000535755	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.181;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,18:64:99:465,0,1544
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12	52314781	52314781	A	G	54.77	PASS	ENSG00000170523	exonic	ENST00000293670	.	synonymous SNV	ENSG00000170523:ENST00000293670:exon9:c.T1332C:p.D444D	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=7.16;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=2.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:83:83,0,383
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12	52423397	52423397	G	A	56.74	PASS	ENSG00000257500	ncRNA_intronic	ENST00000548135	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	52424286	52424286	A	G	313.78	PASS	ENSG00000257500	ncRNA_intronic	ENST00000548135	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.86;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
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12	54684801	54684801	G	A	37.77	PASS	ENSG00000257634	ncRNA_intronic	ENST00000552524	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:66,0,66
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12	54705212	54705212	T	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000552524;ENST00000603132	dist=17778;dist=97534	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
12	54723112	54723112	A	G	43.77	PASS	.	intergenic	ENST00000552524;ENST00000603132	dist=35678;dist=79634	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
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12	56076696	56076696	C	T	162.78	PASS	.	intergenic	ENST00000356464;ENST00000549282	dist=32021;dist=3161	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.13;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:191,0,24
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12	56158153	56158153	C	A	48.28	PASS	ENSG00000257809	ncRNA_intronic	ENST00000548731	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=16.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:76,9,0
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12	56203844	56203844	T	C	141.77	PASS	ENSG00000181852	UTR3	ENST00000345093;ENST00000615206	ENST00000345093:c.*2603A>G;ENST00000615206:c.*2603A>G	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.48;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.917;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:170,0,227
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12	56310431	56310431	G	T	50.77	QD	ENSG00000144785,ENSG00000257303,ENSG00000257727	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=5.579;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.95;ReadPosRankSum=-2.073;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,4:26:79:79,0,749
12	56311654	56311654	T	C	24.78	PASS	ENSG00000257727,ENSG00000257303,ENSG00000144785	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.253;SOR=2.245	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,304
12	56312113	56312113	A	C	498.77	PASS	ENSG00000257727,ENSG00000257303,ENSG00000144785	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.06;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:527,42,0
12	56312501	56312501	T	C	30.77	QD	ENSG00000257303	ncRNA_splicing	ENST00000549565	ENST00000549565:exon2:c.139+2T>C	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=11.083;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.4;ReadPosRankSum=1.158;SOR=2.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:59:59,0,693
12	56312640	56312640	C	T	102.77	PASS	ENSG00000257727,ENSG00000257303,ENSG00000144785	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.409;SOR=1.431	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,263
12	56312802	56312802	T	C	28.77	QD	ENSG00000257303,ENSG00000144785,ENSG00000257727	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.376;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:57:57,0,611
12	56312844	56312844	T	C	552.77	PASS	ENSG00000257727,ENSG00000257303,ENSG00000144785	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=8.418;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:581,0,422
12	56313682	56313682	T	C	20.8	QD	ENSG00000144785,ENSG00000257303,ENSG00000257727	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.624;SOR=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:49:49,0,687
12	56313745	56313745	T	C	335.77	PASS	ENSG00000144785,ENSG00000257303,ENSG00000257727	ncRNA_intronic	ENST00000549565;ENST00000549860	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:364,0,246
12	56321596	56321596	A	G	21.77	PASS	ENSG00000135473	intronic	ENST00000257931;ENST00000425394;ENST00000440411;ENST00000548043;ENST00000610546	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
12	56323108	56323108	T	C	631.77	PASS	ENSG00000135473	exonic	ENST00000257931;ENST00000425394;ENST00000440411;ENST00000548043;ENST00000610546	.	missense SNV	ENSG00000135473:ENST00000257931:exon17:c.A2456G:p.N819S,ENSG00000135473:ENST00000425394:exon17:c.A2459G:p.N820S,ENSG00000135473:ENST00000440411:exon17:c.A2447G:p.N816S,ENSG00000135473:ENST00000548043:exon17:c.A2459G:p.N820S,ENSG00000135473:ENST00000610546:exon17:c.A2459G:p.N820S	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.92;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.9;ReadPosRankSum=1.68;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,27:107:99:660,0,2413
12	56323682	56323682	C	T	63.28	PASS	ENSG00000135473	intronic	ENST00000257931;ENST00000425394;ENST00000440411;ENST00000548043;ENST00000610546	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
12	56328276	56328276	T	G	2365.77	PASS	ENSG00000135473	exonic	ENST00000257931;ENST00000425394;ENST00000440411;ENST00000547572;ENST00000548043;ENST00000610546	.	missense SNV	ENSG00000135473:ENST00000547572:exon3:c.A118C:p.I40L,ENSG00000135473:ENST00000257931:exon4:c.A535C:p.I179L,ENSG00000135473:ENST00000425394:exon4:c.A535C:p.I179L,ENSG00000135473:ENST00000440411:exon4:c.A535C:p.I179L,ENSG00000135473:ENST00000548043:exon4:c.A535C:p.I179L,ENSG00000135473:ENST00000610546:exon4:c.A535C:p.I179L	AC=2;AF=1;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.86;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2394,195,0
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12	56415159	56415159	T	C	72.77	PASS	.	intergenic	ENST00000620583;ENST00000553532	dist=1114;dist=1214	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.1;ReadPosRankSum=0.921;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,139
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12	56415480	56415480	C	T	928.77	PASS	.	downstream	ENST00000553532	dist=893	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.4;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:957,81,0
12	56415535	56415535	T	C	52.77	PASS	.	downstream	ENST00000553532	dist=838	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:81:81,0,407
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12	56415960	56415960	T	C	33.77	PASS	.	downstream	ENST00000553532	dist=413	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,188
12	56415996	56415996	T	C	138.77	PASS	.	downstream	ENST00000553532	dist=377	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.2;SOR=1.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:167,0,179
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12	56418487	56418487	A	T	44.74	PASS	ENSG00000111602	intronic	ENST00000229201;ENST00000553532	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
12	56419012	56419012	C	T	83.28	PASS	ENSG00000111602	intronic	ENST00000229201;ENST00000553532	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.76;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
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12	56422138	56422138	C	T	2550.77	PASS	ENSG00000111602	exonic	ENST00000229201;ENST00000553532	.	missense SNV	ENSG00000111602:ENST00000229201:exon20:c.G2489A:p.R830Q,ENSG00000111602:ENST00000553532:exon20:c.G2492A:p.R831Q	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.711;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,87:303:99:2579,0,7386
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12	130153065	130153065	A	G	1102.77	PASS	ENSG00000250208	ncRNA_exonic	ENST00000505807;ENST00000509760	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.37;SOR=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1131,93,0
12	130154017	130154017	A	G	56.74	PASS	ENSG00000250208	ncRNA_intronic	ENST00000505807;ENST00000509760	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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12	130155317	130155317	T	C	50.77	PASS	ENSG00000250208	ncRNA_exonic	ENST00000542000	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:79:79,0,310
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12	132425371	132425371	A	G	172.77	PASS	.	upstream	ENST00000622182	dist=163	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=28.79;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:99:201,0,104
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13	40906008	40906008	T	C	40.77	PASS	ENSG00000239827,ENSG00000168852	ncRNA_intronic	ENST00000379515;ENST00000632487;ENST00000633547;ENST00000633814	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,76
13	40906237	40906237	T	C	21.77	PASS	ENSG00000239827,ENSG00000168852	ncRNA_intronic	ENST00000379515;ENST00000632487;ENST00000633547;ENST00000633814	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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13	50955657	50955657	C	T	168.9	PASS	ENSG00000136104	intronic	ENST00000336617;ENST00000422660;ENST00000611510	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.78;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
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13	51007926	51007926	T	C	105.03	PASS	ENSG00000123201	ncRNA_intronic	ENST00000493639;ENST00000531898;ENST00000533288	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
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13	73543608	73543608	C	T	52.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000443621	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.59;ReadPosRankSum=0;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:74:81,0,74
13	73546158	73546158	A	C	711.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000443621	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=8.773;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.63	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,29:112:99:740,0,2673
13	73555240	73555240	T	A	136.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:58:165,0,58
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13	73583780	73583780	T	C	21.77	PASS	ENSG00000228295,ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000430033;ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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13	73588558	73588558	G	A	89.78	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:118,0,27
13	73590131	73590131	C	A	105.03	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
13	73591287	73591287	G	A	105.03	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
13	73595125	73595125	C	T	107.28	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.54;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	73595215	73595215	T	C	97.28	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
13	73595278	73595278	T	C	33.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,189
13	73595343	73595343	T	C	25.78	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.3;ReadPosRankSum=0.842;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:54:54,0,115
13	73595540	73595540	G	A	69.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.18;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,220
13	73595577	73595577	T	C	222.84	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.8;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
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13	73597901	73597901	C	T	23.76	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=11.88;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
13	73599109	73599109	T	C	180.9	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.57;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
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13	73602097	73602097	T	G	105.03	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
13	73602256	73602256	A	G	47.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:34:76,0,34
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13	73604788	73604788	T	G	188.84	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.47;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
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13	73605312	73605312	A	T	47.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:76,0,69
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13	73609701	73609701	T	C	1452.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.77;SOR=1.096	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1481,117,0
13	73609877	73609877	G	T	2010.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.43;SOR=0.931	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2039,162,0
13	73611086	73611086	C	T	389.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=23.63;SOR=4.804	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
13	73613877	73613877	A	T	107.28	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.48;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	73613887	73613887	A	T	107.28	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=35.71;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	73614798	73614798	A	G	169.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:198,0,289
13	73614904	73614904	T	A	232.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:261,0,272
13	73617405	73617405	G	A	417.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.953;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:446,0,193
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13	73643595	73643595	C	G	40.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,301
13	73643710	73643710	T	C	33.77	PASS	ENSG00000224853	ncRNA_intronic	ENST00000452852	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,188
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13	109271011	109271011	G	A	222.84	PASS	ENSG00000275216	ncRNA_exonic	ENST00000618966	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
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13	110477208	110477208	A	G	62.74	PASS	ENSG00000134871	intronic	ENST00000360467	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
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14	19105490	19105490	A	C	39.77	PASS	ENSG00000225210	ncRNA_intronic	ENST00000547220;ENST00000610585	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.94;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,113
14	19105498	19105498	C	G	36.77	PASS	ENSG00000225210	ncRNA_intronic	ENST00000547220;ENST00000610585	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,155
14	19105534	19105534	G	A	144.77	PASS	ENSG00000225210	ncRNA_intronic	ENST00000547220;ENST00000610585	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.725;SOR=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:173,0,244
14	19105551	19105551	A	G	233.77	PASS	ENSG00000225210	ncRNA_intronic	ENST00000547220;ENST00000610585	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=23.38;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=3.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:95:262,0,95
14	19106299	19106299	C	T	84.77	PASS	ENSG00000225210	ncRNA_intronic	ENST00000547220;ENST00000610585	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.19;ReadPosRankSum=0;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
14	19106522	19106522	C	A	183.77	PASS	ENSG00000225210	ncRNA_intronic	ENST00000547220;ENST00000610585	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.42;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:98:212,0,98
14	19106684	19106684	A	G	514.77	PASS	ENSG00000225210	ncRNA_intronic	ENST00000547220;ENST00000610585	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=35.37;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:543,39,0
14	19124261	19124261	A	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000547220;ENST00000610763	dist=8991;dist=3475	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	19130790	19130790	A	G	138.77	PASS	ENSG00000277128	ncRNA_intronic	ENST00000610763	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:167,0,334
14	19131089	19131089	T	C	40.77	PASS	ENSG00000277128	ncRNA_intronic	ENST00000610763	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,78
14	19267981	19267981	A	G	56.74	PASS	ENSG00000277156	ncRNA_exonic	ENST00000616611	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	19293313	19293313	T	A	56.74	PASS	ENSG00000244306	ncRNA_exonic	ENST00000612696	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	19299585	19299585	C	T	24.78	PASS	ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,311
14	19299597	19299597	A	T	30.77	PASS	ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.85;ReadPosRankSum=0;SOR=2.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,233
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14	19301684	19301684	G	A	139.03	PASS	ENSG00000279508,ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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14	19302086	19302086	G	T	294.9	PASS	ENSG00000279508	exonic	ENST00000624585	.	synonymous SNV	ENSG00000279508:ENST00000624585:exon1:c.C478A:p.R160R	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.14;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=32.77;ReadPosRankSum=0.282;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:15:323,0,15
14	19302437	19302437	G	A	593.77	PASS	ENSG00000279508	exonic	ENST00000624585	.	missense SNV	ENSG00000279508:ENST00000624585:exon1:c.C127T:p.R43C	AC=2;AF=1;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.69;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:622,48,0
14	19302722	19302722	C	G	180.9	PASS	ENSG00000244306,ENSG00000279508,ENSG00000228294	ncRNA_intronic	ENST00000444357;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.59;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
14	19304164	19304164	C	T	138.77	PASS	ENSG00000228294,ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000444357;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:167,0,334
14	19304177	19304177	C	T	101.77	PASS	ENSG00000228294,ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000444357;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.33	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:130,0,259
14	19304260	19304260	A	G	81.77	PASS	ENSG00000244306,ENSG00000228294	ncRNA_intronic	ENST00000444357;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:110,0,68
14	19305520	19305520	C	T	56.74	PASS	ENSG00000228294,ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000444357;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	19307040	19307040	A	G	198.77	PASS	ENSG00000244306,ENSG00000228294	ncRNA_exonic	ENST00000549065;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.319;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:227,0,59
14	19307075	19307075	T	C	123.78	PASS	ENSG00000244306,ENSG00000228294	ncRNA_exonic	ENST00000549065;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.76;ReadPosRankSum=0;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:152,0,27
14	19313658	19313658	T	C	39.77	PASS	ENSG00000228294,ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000413661;ENST00000444357;ENST00000549065;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.253;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,107
14	19313784	19313784	A	C	39.77	PASS	ENSG00000228294,ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000413661;ENST00000444357;ENST00000549065;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,110
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14	19335107	19335107	C	T	56.74	PASS	ENSG00000244306	ncRNA_intronic	ENST00000549065;ENST00000610531;ENST00000612696;ENST00000614614;ENST00000616922;ENST00000619784	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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14	23984686	23984686	A	G	31.77	PASS	ENSG00000215256	ncRNA_intronic	ENST00000558423	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.345;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,175
14	23985784	23985784	A	G	88.77	PASS	ENSG00000215256	ncRNA_intronic	ENST00000558423	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:117,0,75
14	23985795	23985795	A	G	49.77	PASS	ENSG00000215256	ncRNA_intronic	ENST00000558423	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
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14	23986109	23986109	A	G	335.77	PASS	ENSG00000215256	ncRNA_intronic	ENST00000558423	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:47:364,0,47
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14	60977036	60977036	A	T	42.52	PASS	ENSG00000258892	ncRNA_intronic	ENST00000553946	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.26;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
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14	61043206	61043206	T	C	760.77	PASS	ENSG00000139974	exonic	ENST00000267488;ENST00000354886;ENST00000451406;ENST00000529212;ENST00000533744	.	synonymous SNV	ENSG00000139974:ENST00000529212:exon1:c.T57C:p.G19G,ENSG00000139974:ENST00000267488:exon9:c.T684C:p.G228G,ENSG00000139974:ENST00000354886:exon9:c.T684C:p.G228G,ENSG00000139974:ENST00000451406:exon9:c.T669C:p.G223G	AC=2;AF=1;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.66;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:789,60,0
14	61082729	61082729	C	T	44.74	PASS	ENSG00000139974	intronic	ENST00000354886;ENST00000451406;ENST00000491344;ENST00000525723;ENST00000526539;ENST00000529345	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
14	61095716	61095716	C	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000525723;ENST00000555185	dist=11983;dist=91843	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
14	61278574	61278574	G	A	1641.77	PASS	ENSG00000182107	UTR3	ENST00000555868	ENST00000555868:c.*1518C>T	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.93;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1670,140,0
14	61278699	61278699	A	G	1148.77	PASS	ENSG00000182107	UTR3	ENST00000555868	ENST00000555868:c.*1393T>C	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.67;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,38:53:99:1177,0,388
14	61280876	61280876	G	A	373.77	PASS	ENSG00000182107	exonic	ENST00000555868	.	missense SNV	ENSG00000182107:ENST00000555868:exon1:c.C272T:p.P91L	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,12:33:99:402,0,641
14	61280926	61280926	A	G	1114.77	PASS	ENSG00000182107	exonic	ENST00000555868	.	synonymous SNV	ENSG00000182107:ENST00000555868:exon1:c.T222C:p.G74G	AC=2;AF=1;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.122;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;MQRankSum=0;QD=35;ReadPosRankSum=1.603;SOR=1.108	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,30:31:51:1143,51,0
14	61322600	61322600	C	G	56.74	PASS	ENSG00000247287,ENSG00000027075	ncRNA_exonic	ENST00000500036;ENST00000554086	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61530508	61530508	C	T	370.77	PASS	ENSG00000258989,ENSG00000027075	exonic	ENST00000332981;ENST00000555082;ENST00000555185;ENST00000556347	.	synonymous SNV	ENSG00000027075:ENST00000555185:exon4:c.C378T:p.N126N,ENSG00000027075:ENST00000332981:exon12:c.C1674T:p.N558N,ENSG00000027075:ENST00000555082:exon12:c.C1191T:p.N397N	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.9;ReadPosRankSum=0.58;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:399,0,714
14	61536085	61536085	T	A	21.77	PASS	ENSG00000258989,ENSG00000027075	intronic	ENST00000332981;ENST00000555082;ENST00000556347	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
14	61541347	61541347	C	T	56.74	PASS	ENSG00000258926	ncRNA_intronic	ENST00000556543	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61547571	61547571	T	A	56.74	PASS	ENSG00000258989,ENSG00000027075	intronic	ENST00000332981;ENST00000555082;ENST00000556347	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61556546	61556546	A	C	236.77	PASS	ENSG00000250548,ENSG00000258989	ncRNA_exonic	ENST00000508827;ENST00000553288	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.78;ReadPosRankSum=0;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:265,0,138
14	61557049	61557049	T	C	56.74	PASS	ENSG00000250548,ENSG00000258989	ncRNA_intronic	ENST00000508827;ENST00000553288	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61570579	61570579	C	A	605.77	PASS	ENSG00000232774,ENSG00000250548,ENSG00000258989	ncRNA_exonic	ENST00000229465;ENST00000508827	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.6;SOR=1.244	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:634,48,0
14	61653857	61653857	C	T	258.8	PASS	ENSG00000258989,ENSG00000232774	ncRNA_exonic	ENST00000229465;ENST00000556569;ENST00000556717	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.66;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
14	61654049	61654049	T	G	23.76	PASS	ENSG00000232774	ncRNA_exonic	ENST00000556569	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=11.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
14	61656079	61656079	T	A	196.9	PASS	ENSG00000232774	ncRNA_intronic	ENST00000229465	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.15;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
14	61656838	61656838	G	C	56.74	PASS	ENSG00000232774	ncRNA_exonic	ENST00000229465	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61657206	61657206	T	C	56.74	PASS	ENSG00000232774	ncRNA_intronic	ENST00000229465	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61657796	61657796	G	T	647.77	PASS	ENSG00000232774	ncRNA_exonic	ENST00000229465	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.55;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:676,51,0
14	61658920	61658920	T	C	56.74	PASS	.	downstream	ENST00000229465;ENST00000556347	dist=224	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61681707	61681707	G	C	56.74	PASS	ENSG00000258777	ncRNA_intronic	ENST00000557544	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	61704708	61704708	A	C	23.76	PASS	ENSG00000100644	intronic	ENST00000323441;ENST00000337138;ENST00000394997;ENST00000539097;ENST00000557538	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=11.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
14	61708555	61708555	T	C	139.03	PASS	ENSG00000100644	intronic	ENST00000323441;ENST00000337138;ENST00000394997;ENST00000539097;ENST00000557538	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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14	61725810	61725810	G	A	97.28	PASS	ENSG00000258667	ncRNA_intronic	ENST00000554254	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	61729227	61729227	C	A	56.74	PASS	ENSG00000258667	ncRNA_intronic	ENST00000554254	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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14	73595264	73595264	T	C	1884.77	PASS	ENSG00000177465	exonic	ENST00000326303	.	synonymous SNV	ENSG00000177465:ENST00000326303:exon3:c.T876C:p.I292I	AC=2;AF=1;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.9;SOR=1.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1913,162,0
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14	73604624	73604624	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000326303;ENST00000554229	dist=8128;dist=6321	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	73605877	73605877	T	C	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000326303;ENST00000554229	dist=9381;dist=5068	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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14	103143588	103143588	C	T	180.9	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=1629;dist=5009	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.17;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
14	103144202	103144202	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=2243;dist=4395	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	103144568	103144568	G	C	62.74	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=2609;dist=4029	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	103144575	103144575	C	T	62.74	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=2616;dist=4022	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	103144763	103144763	C	T	44.74	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=2804;dist=3834	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
14	103144902	103144902	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=2943;dist=3695	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	103145941	103145941	C	T	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=3982;dist=2656	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	103146225	103146225	T	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=4266;dist=2372	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	103146430	103146430	G	A	44.74	PASS	.	intergenic	ENST00000600530;ENST00000559810	dist=4471;dist=2167	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
14	103148631	103148631	G	A	97.28	PASS	ENSG00000259535	ncRNA_exonic	ENST00000559810	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	103149660	103149660	A	G	105.03	PASS	.	downstream	ENST00000559810	dist=252	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
14	103150409	103150409	T	A	85	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=1001;dist=33795	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.25;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:122,12,0
14	103150547	103150547	A	G	42.77	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=1139;dist=33657	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
14	103151472	103151472	A	C	86.77	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=2064;dist=32732	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:115,0,65
14	103151613	103151613	C	T	123.78	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=2205;dist=32591	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:152,0,27
14	103151939	103151939	A	T	46.77	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=2531;dist=32265	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
14	103152072	103152072	A	G	46.77	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=2664;dist=32132	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
14	103152978	103152978	G	A	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=3570;dist=31226	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	103153994	103153994	A	G	40.77	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=4586;dist=30210	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,76
14	103154288	103154288	C	T	62.74	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=4880;dist=29916	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	103154313	103154313	G	A	62.74	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=4905;dist=29891	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	103157607	103157607	A	G	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=8199;dist=26597	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
14	103163199	103163199	A	G	51.28	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=13791;dist=21005	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=17.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:79,9,0
14	103170360	103170360	A	G	222.84	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=20952;dist=13844	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=23.9;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
14	103170412	103170412	T	C	196.77	PASS	.	intergenic	ENST00000559810;ENST00000560971	dist=21004;dist=13792	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:225,0,100
14	103212044	103212044	A	G	81.77	PASS	.	intergenic	ENST00000618272;ENST00000488305	dist=3168;dist=29448	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:34:110,0,34
14	103212101	103212101	A	G	40.77	PASS	.	intergenic	ENST00000618272;ENST00000488305	dist=3225;dist=29391	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,76
14	103222232	103222232	T	C	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000618272;ENST00000488305	dist=13356;dist=19260	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
14	103239492	103239492	G	A	44.74	PASS	.	intergenic	ENST00000618272;ENST00000488305	dist=30616;dist=2000	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
14	103241080	103241080	C	T	43.77	PASS	.	upstream	ENST00000488305	dist=412	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=0;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
14	103241128	103241128	T	C	139.03	PASS	.	upstream	ENST00000488305	dist=364	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
14	103274080	103274080	G	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000488305;ENST00000605103	dist=32108;dist=5143	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	103279636	103279636	G	A	43.77	PASS	ENSG00000270938	ncRNA_exonic	ENST00000605103;ENST00000605179	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=0;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
14	103279856	103279856	T	G	187.77	PASS	ENSG00000270938	ncRNA_exonic	ENST00000605179	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.33	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:216,0,192
14	103280359	103280359	G	A	221.77	PASS	.	downstream	ENST00000605103;ENST00000605179	dist=404	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.664;SOR=1.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:250,0,249
14	103332702	103332702	C	T	72.77	PASS	.	upstream	ENST00000563989	dist=335	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.1;ReadPosRankSum=0.489;SOR=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,185
14	103333358	103333358	G	A	514.77	PASS	.	upstream	ENST00000216554;ENST00000560338;ENST00000560763;ENST00000563989	dist=644	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.05;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:543,39,0
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15	22236744	22236744	C	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000408714;ENST00000553429	dist=11415;dist=21394	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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15	22253680	22253680	G	A	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000408714;ENST00000553429	dist=28351;dist=4458	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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15	22263947	22263947	T	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000553429;ENST00000556034	dist=5099;dist=15024	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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15	22683395	22683395	G	A	271.78	PASS	ENSG00000276141	ncRNA_intronic	ENST00000621139	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.97;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:300,24,0
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15	22732764	22732764	C	T	56.74	PASS	ENSG00000275325	ncRNA_exonic	ENST00000622242	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	22764485	22764485	G	A	62.74	PASS	ENSG00000274253	ncRNA_exonic	ENST00000618814;ENST00000619879	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	22773777	22773777	G	C	59.74	PASS	ENSG00000259425	ncRNA_exonic	ENST00000559740	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	22774346	22774346	G	A	56.74	PASS	ENSG00000259425,ENSG00000170113,ENSG00000274253	ncRNA_intronic	ENST00000559740;ENST00000559762;ENST00000617410;ENST00000619611	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	22774656	22774656	C	T	56.74	PASS	ENSG00000259425,ENSG00000170113,ENSG00000274253	ncRNA_exonic	ENST00000559740;ENST00000559762;ENST00000560434;ENST00000617410	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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15	45184814	45184814	A	G	180.9	PASS	ENSG00000259519	ncRNA_intronic	ENST00000560034	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.07;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
15	45186385	45186385	T	C	188.84	PASS	ENSG00000259519	ncRNA_intronic	ENST00000560034	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.47;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
15	45187153	45187153	T	C	21.77	PASS	ENSG00000259519	ncRNA_intronic	ENST00000560034	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
15	45197075	45197075	A	T	21.77	PASS	ENSG00000259519	ncRNA_intronic	ENST00000560034	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
15	45235954	45235954	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000559063;ENST00000559003	dist=20011;dist=15626	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	45235980	45235980	A	G	44.74	PASS	.	intergenic	ENST00000559063;ENST00000559003	dist=20037;dist=15600	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
15	45251972	45251972	A	G	195.8	PASS	ENSG00000259520	ncRNA_exonic	ENST00000559003	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.97;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:224,21,0
15	45278027	45278027	C	G	62.74	PASS	ENSG00000259520	ncRNA_intronic	ENST00000560344;ENST00000561404	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	45278043	45278043	A	G	104.28	PASS	ENSG00000259520	ncRNA_intronic	ENST00000560344;ENST00000561404	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	45281664	45281664	G	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000561404;ENST00000560007	dist=2413;dist=39413	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
15	45389546	45389546	T	C	56.74	PASS	ENSG00000171766	intronic	ENST00000561148	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	45450019	45450019	A	T	44.74	PASS	ENSG00000259354	ncRNA_intronic	ENST00000558536;ENST00000559869	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
15	45450454	45450454	A	G	56.74	PASS	ENSG00000259354	ncRNA_intronic	ENST00000558536;ENST00000559869;ENST00000560077;ENST00000560647	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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15	45482343	45482343	T	C	33.77	PASS	ENSG00000259354,ENSG00000104154	ncRNA_intronic	ENST00000558536;ENST00000560647	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,184
15	45482415	45482415	T	C	42.77	PASS	ENSG00000259354,ENSG00000104154	ncRNA_intronic	ENST00000558536;ENST00000560647	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
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15	88942494	88942494	C	T	62.74	PASS	.	intergenic	ENST00000268150;ENST00000559344	dist=29083;dist=10189	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
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15	89077439	89077439	T	C	56.74	PASS	ENSG00000260123	ncRNA_intronic	ENST00000565938	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	89079588	89079588	T	A	139.03	PASS	ENSG00000260123	ncRNA_intronic	ENST00000565938	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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15	100850469	100850469	G	A	190.9	PASS	ENSG00000232386	ncRNA_splicing	ENST00000558254	ENST00000558254:exon2:c.386+1G>A	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.42;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:15:219,15,0
15	100850476	100850476	A	T	190.9	PASS	ENSG00000272808,ENSG00000232386	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.56;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
15	100851752	100851752	C	A	77.28	PASS	ENSG00000272808,ENSG00000232386	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.76;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:105,9,0
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15	100852340	100852340	A	G	193.9	PASS	ENSG00000272808,ENSG00000232386	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.82;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
15	100852767	100852767	A	G	97.28	PASS	ENSG00000272808,ENSG00000232386	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	100853342	100853342	G	A	127.03	PASS	ENSG00000232386,ENSG00000272808	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
15	100854298	100854298	C	T	263.8	PASS	ENSG00000272808,ENSG00000232386	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.48;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
15	100854898	100854898	A	G	139.03	PASS	ENSG00000272808,ENSG00000232386	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
15	100855325	100855325	C	T	189.9	SnpCluster	ENSG00000232386,ENSG00000272808	ncRNA_exonic	ENST00000431060;ENST00000558254;ENST00000558427	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.56;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
15	100855336	100855336	G	A	149.03	SnpCluster	ENSG00000272808,ENSG00000232386	ncRNA_exonic	ENST00000431060;ENST00000558254;ENST00000558427	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.14;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
15	100855340	100855340	G	A	56.74	SnpCluster	ENSG00000232386,ENSG00000272808	ncRNA_exonic	ENST00000431060;ENST00000558254;ENST00000558427	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	100855519	100855519	G	T	139.03	PASS	ENSG00000232386,ENSG00000272808	ncRNA_intronic	ENST00000431060;ENST00000557962;ENST00000558254;ENST00000558427;ENST00000559331;ENST00000561231	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
15	100861387	100861387	G	A	56.74	PASS	ENSG00000272808	ncRNA_exonic	ENST00000431060	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	100861891	100861891	A	G	738.77	PASS	ENSG00000259604,ENSG00000272808	ncRNA_exonic	ENST00000431060;ENST00000558475;ENST00000558641;ENST00000559673;ENST00000593314	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=36.26;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:767,60,0
15	100862456	100862456	A	G	59.74	PASS	ENSG00000272808	ncRNA_exonic	ENST00000431060	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.01;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
15	100862472	100862472	A	G	101.28	PASS	ENSG00000272808	ncRNA_exonic	ENST00000431060	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.76;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
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15	100872857	100872857	A	G	271.78	PASS	ENSG00000259604,ENSG00000272639	ncRNA_intronic	ENST00000558475;ENST00000558568;ENST00000558641	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.97;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:300,24,0
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15	101027342	101027342	G	C	97.28	PASS	ENSG00000154237	exonic	ENST00000388948	.	synonymous SNV	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon18:c.G2487C:p.V829V	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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15	101055475	101055475	G	A	56.74	PASS	ENSG00000259755	ncRNA_intronic	ENST00000559857	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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15	101058109	101058109	C	T	139.03	PASS	ENSG00000154237,ENSG00000259755	exonic	ENST00000388948;ENST00000526457	.	synonymous SNV	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon29:c.C4647T:p.T1549T	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
15	101059041	101059041	T	C	21.77	PASS	ENSG00000259755	ncRNA_intronic	ENST00000559857	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
15	101116615	101116615	C	T	21.77	PASS	ENSG00000259365	ncRNA_exonic	ENST00000560938	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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17	6984765	6984765	T	C	235.84	PASS	ENSG00000215067	ncRNA_intronic	ENST00000570562;ENST00000572385;ENST00000575889	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.52;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
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17	6996240	6996240	C	G	764.77	PASS	ENSG00000108839	exonic	ENST00000251535	.	synonymous SNV	ENSG00000108839:ENST00000251535:exon1:c.C123G:p.P41P	AC=2;AF=1;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.76;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:793,57,0
17	6996310	6996310	C	T	514.77	PASS	ENSG00000267047,ENSG00000108839,ENSG00000215067	ncRNA_intronic	ENST00000399541;ENST00000570562;ENST00000572385;ENST00000572547;ENST00000575889	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.09;SOR=5.283	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:543,39,0
17	6996412	6996412	T	C	544.77	PASS	ENSG00000108839,ENSG00000267047,ENSG00000215067	ncRNA_intronic	ENST00000399541;ENST00000570562;ENST00000572385;ENST00000572547;ENST00000575889	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.97;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:573,42,0
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17	43347027	43347027	G	T	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000433702;ENST00000624705	dist=41051;dist=13014	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
17	43347551	43347551	C	G	203.78	PASS	.	intergenic	ENST00000433702;ENST00000624705	dist=41575;dist=12490	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.47;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:232,24,0
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17	43348789	43348789	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000433702;ENST00000624705	dist=42813;dist=11252	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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17	43350353	43350353	A	G	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000433702;ENST00000624705	dist=44377;dist=9688	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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17	43360385	43360385	G	A	163.77	PASS	ENSG00000279602	ncRNA_exonic	ENST00000624705	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:192,0,59
17	43361306	43361306	G	A	21.77	PASS	ENSG00000279602	ncRNA_exonic	ENST00000624705	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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17	43363265	43363265	A	G	107.28	PASS	.	intergenic	ENST00000624705;ENST00000341011	dist=1904;dist=6580	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.54;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	43365021	43365021	G	C	62.74	PASS	.	intergenic	ENST00000624705;ENST00000341011	dist=3660;dist=4824	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	43365037	43365037	T	C	62.74	PASS	.	intergenic	ENST00000624705;ENST00000341011	dist=3676;dist=4808	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	43366423	43366423	C	T	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000624705;ENST00000341011	dist=5062;dist=3422	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
17	43370860	43370860	A	G	97.28	PASS	ENSG00000188825	ncRNA_exonic	ENST00000341011	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	43370932	43370932	G	A	97.28	PASS	ENSG00000188825	ncRNA_exonic	ENST00000341011	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	43376399	43376399	T	C	56.74	PASS	ENSG00000188825	ncRNA_exonic	ENST00000592135	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	43376443	43376443	T	C	56.74	PASS	ENSG00000188825	ncRNA_exonic	ENST00000592135	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	43376640	43376640	G	C	63.28	PASS	ENSG00000188825	ncRNA_exonic	ENST00000592135	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
17	43377074	43377074	G	T	56.74	PASS	ENSG00000188825	ncRNA_exonic	ENST00000592135	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	43379452	43379452	T	A	62.74	PASS	ENSG00000188825	ncRNA_intronic	ENST00000341011;ENST00000587874;ENST00000592094;ENST00000592135	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
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17	45560061	45560061	T	C	62.74	PASS	ENSG00000267198	ncRNA_intronic	ENST00000586348	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	45562099	45562099	T	C	56.74	PASS	ENSG00000267198	ncRNA_intronic	ENST00000586348	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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17	45574056	45574056	T	C	116.78	PASS	.	intergenic	ENST00000586348;ENST00000580842	dist=10826;dist=11815	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.46;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:145,0,24
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17	45641243	45641243	A	G	368.77	PASS	ENSG00000263715,ENSG00000204650	ncRNA_exonic	ENST00000578000;ENST00000580655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.799;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.823;SOR=1.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:397,0,447
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17	65101281	65101281	A	C	4532.77	PASS	ENSG00000263470	ncRNA_exonic	ENST00000582940	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.96;SOR=1.028	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:4561,346,0
17	65102508	65102508	A	G	335.78	PASS	ENSG00000263470	ncRNA_intronic	ENST00000582940	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.2;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
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18	66492166	66492166	T	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000584766;ENST00000262150	dist=422519;dist=8917	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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19	14162829	14162829	A	G	7522.77	PASS	ENSG00000267169,ENSG00000072071	exonic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	synonymous SNV	ENSG00000072071:ENST00000361434:exon5:c.T972C:p.R324R,ENSG00000072071:ENST00000340736:exon6:c.T987C:p.R329R	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.69;ClippingRankSum=0;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.02;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,255:490:99:7551,0,6687
19	14163821	14163821	G	C	2030.77	PASS	ENSG00000072071,ENSG00000267169	ncRNA_intronic	ENST00000588387;ENST00000592086	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=7.715;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.27	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,69:113:99:2059,0,1158
19	14164688	14164688	G	C	286.77	FS	ENSG00000267169,ENSG00000072071	ncRNA_intronic	ENST00000588387;ENST00000592086	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-6.43;ClippingRankSum=0;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=152.201;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.46;ReadPosRankSum=-4.093;SOR=5.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,19:83:99:315,0,3770
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19	14164957	14164957	A	G	938.77	PASS	ENSG00000267169,ENSG00000072071	ncRNA_intronic	ENST00000588387;ENST00000592086	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.42;SOR=1.075	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,30:61:99:967,0,1009
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19	14172131	14172131	T	C	56.74	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	14180809	14180809	T	C	21.77	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	14186486	14186486	G	A	147.77	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.11;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:176,0,62
19	14192028	14192028	G	C	139.03	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	14192107	14192107	G	A	120.77	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:149,0,65
19	14195668	14195668	C	T	21.77	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	14196133	14196133	A	G	97.28	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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19	14197025	14197025	T	C	36.77	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.13;ReadPosRankSum=0;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,149
19	14197756	14197756	C	T	44.74	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
19	14197965	14197965	C	T	56.74	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	14202084	14202084	C	G	62.74	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	14202092	14202092	G	A	62.74	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	14203828	14203828	G	T	107.28	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.97;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	14203969	14203969	G	A	55.74	PASS	ENSG00000072071	intronic	ENST00000340736;ENST00000361434	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	14206538	14206538	G	T	3363.77	PASS	.	upstream	ENST00000340736;ENST00000361434	dist=351	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.73;SOR=1.364	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:3392,271,0
19	14210254	14210254	T	C	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000340736;ENST00000461840	dist=4067;dist=2798	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	14268099	14268099	T	C	56.74	PASS	ENSG00000267406,ENSG00000267723	ncRNA_intronic	ENST00000589512;ENST00000592263	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	14279877	14279877	C	A	105.03	PASS	ENSG00000267723	ncRNA_exonic	ENST00000592263	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
19	14280061	14280061	T	C	46.77	PASS	ENSG00000267723	ncRNA_intronic	ENST00000592263	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
19	14293525	14293525	G	C	97.28	PASS	.	upstream	ENST00000592263	dist=320	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	14320132	14320132	T	C	56.74	PASS	ENSG00000266913	ncRNA_intronic	ENST00000586698	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	14333919	14333919	T	G	39.77	PASS	ENSG00000267147	ncRNA_exonic	ENST00000588275	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,110
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19	19792453	19792453	A	G	188.84	PASS	ENSG00000081665	exonic	ENST00000586260	.	synonymous SNV	ENSG00000081665:ENST00000586260:exon4:c.T258C:p.S86S	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.47;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
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19	19796015	19796015	A	G	42.77	PASS	ENSG00000267581,ENSG00000081665,ENSG00000267419	ncRNA_intronic	ENST00000589657;ENST00000590274;ENST00000591884	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.674;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
19	19796245	19796245	T	C	47.77	PASS	ENSG00000267581,ENSG00000081665,ENSG00000267419	ncRNA_intronic	ENST00000589657;ENST00000590274;ENST00000591884	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.55;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:34:76,0,34
19	19797226	19797226	G	A	42.77	PASS	ENSG00000267419,ENSG00000081665,ENSG00000267581	ncRNA_intronic	ENST00000589657;ENST00000590274;ENST00000591884	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
19	19797524	19797524	C	T	97.28	PASS	ENSG00000267581,ENSG00000267419,ENSG00000081665	ncRNA_intronic	ENST00000589657;ENST00000590274;ENST00000591884	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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19	19798911	19798911	C	T	50.77	PASS	ENSG00000267581,ENSG00000081665,ENSG00000267419	ncRNA_intronic	ENST00000589657;ENST00000590274;ENST00000591884	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
19	19799441	19799441	T	C	323.77	PASS	ENSG00000081665	exonic	ENST00000545006	.	synonymous SNV	ENSG00000081665:ENST00000545006:exon4:c.A236G:p.X79X	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:32:352,0,32
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19	19894894	19894894	A	G	21.8	QD	ENSG00000267565	ncRNA_intronic	ENST00000585571	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.09;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=0.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,492
19	19895157	19895157	A	G	163.77	PASS	ENSG00000267565	ncRNA_intronic	ENST00000585571	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:192,0,59
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19	20139045	20139045	G	C	50.77	PASS	ENSG00000267383,ENSG00000267220	ncRNA_intronic	ENST00000586657;ENST00000590606;ENST00000592921;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
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19	20176158	20176158	T	C	21.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000585498	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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19	20187049	20187049	C	A	59.74	PASS	ENSG00000256229,ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.56;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
19	20187064	20187064	T	G	59.74	PASS	ENSG00000267383,ENSG00000256229	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	20196968	20196968	G	A	427.77	PASS	ENSG00000256229	exonic	ENST00000335117	.	synonymous SNV	ENSG00000256229:ENST00000335117:exon4:c.G258A:p.V86V	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.458;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,16:48:99:456,0,1044
19	20197492	20197492	G	C	694.77	PASS	ENSG00000256229	exonic	ENST00000335117	.	missense SNV	ENSG00000256229:ENST00000335117:exon4:c.G782C:p.S261T	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,23:45:99:723,0,750
19	20198145	20198145	C	T	496.77	PASS	ENSG00000256229,ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.847;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,20:49:99:525,0,836
19	20198237	20198237	A	G	296.77	PASS	ENSG00000256229,ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,10:33:99:325,0,771
19	20198893	20198893	T	C	418.77	PASS	ENSG00000256229,ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.479;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,13:32:99:447,0,663
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19	20199308	20199308	C	T	272.77	PASS	ENSG00000267383,ENSG00000256229	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.201;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,10:39:99:301,0,986
19	20199325	20199325	G	A	283.77	PASS	ENSG00000267383,ENSG00000256229	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.108;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,10:35:99:312,0,871
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19	20199670	20199670	T	C	261.77	PASS	ENSG00000256229,ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.487;SOR=1.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,11:41:99:290,0,947
19	20199857	20199857	C	T	317.77	PASS	ENSG00000256229,ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.646;SOR=0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,13:51:99:346,0,1253
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19	20202067	20202067	A	G	21.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	20202910	20202910	T	C	62.74	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	20202921	20202921	T	C	62.74	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	20203538	20203538	G	A	21.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	20211010	20211010	T	C	21.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	20211891	20211891	C	T	21.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	20214469	20214469	C	G	84.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.19;ReadPosRankSum=0;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
19	20214609	20214609	G	A	45.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.26;ReadPosRankSum=0;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
19	20215844	20215844	G	T	139.03	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	20216532	20216532	C	T	46.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000592022	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
19	20216590	20216590	A	T	85.28	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000592022	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
19	20220417	20220417	C	G	59.74	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000592022	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	20220781	20220781	G	A	43.77	PASS	ENSG00000280079	ncRNA_exonic	ENST00000624228	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.29;ReadPosRankSum=0;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,248
19	20220790	20220790	C	T	43.77	PASS	ENSG00000280079	ncRNA_exonic	ENST00000624228	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.431;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,248
19	20221098	20221098	T	G	397.77	PASS	ENSG00000280079	ncRNA_exonic	ENST00000624228	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.448;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,14:27:99:426,0,394
19	20221200	20221200	T	C	347.77	PASS	ENSG00000280079	ncRNA_exonic	ENST00000624228	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.452;SOR=0.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:376,0,284
19	20221346	20221346	T	A	340.77	PASS	ENSG00000280079	ncRNA_exonic	ENST00000624228	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.66;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=14.2;ReadPosRankSum=1.174;SOR=1.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:369,0,315
19	20221972	20221972	G	A	151.77	PASS	ENSG00000280079,ENSG00000271524,ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000605448;ENST00000624228	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:180,0,203
19	20222183	20222183	A	G	88.77	PASS	ENSG00000280079,ENSG00000271524,ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000605448;ENST00000624228	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.1;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:89:117,0,89
19	20223718	20223718	T	G	300.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.253;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:329,0,327
19	20224414	20224414	G	A	70.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.992;SOR=2.78	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:99,0,189
19	20224932	20224932	T	C	221.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=22.18;ReadPosRankSum=0.21;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:95:250,0,95
19	20225250	20225250	A	T	181.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:210,0,59
19	20225418	20225418	C	T	150.78	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.21;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:179,0,24
19	20225746	20225746	A	C	69.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,224
19	20225811	20225811	T	C	72.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.1;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,184
19	20226124	20226124	T	A	138.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:167,0,220
19	20226300	20226300	C	A	223.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.74;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.721;SOR=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:252,0,316
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19	20227330	20227330	T	C	24.78	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,292
19	20227719	20227719	C	T	85.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=0;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,313
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19	20228309	20228309	G	A	156.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000585816	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.6;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:67:185,0,67
19	20231168	20231168	T	C	21.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000585816;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	20235968	20235968	A	C	42.74	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000585816;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
19	20236466	20236466	T	C	21.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_intronic	ENST00000585498;ENST00000585816;ENST00000586657;ENST00000593655	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
19	20238376	20238376	G	A	226.77	PASS	ENSG00000267383	ncRNA_exonic	ENST00000585498;ENST00000585816;ENST00000586657	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:255,0,213
19	20337654	20337654	T	C	44.74	PASS	.	intergenic	ENST00000612475;ENST00000542380	dist=6137;dist=2615	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
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19	20394932	20394932	A	C	81.77	PASS	ENSG00000231205	ncRNA_intronic	ENST00000541160;ENST00000542380	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.3;ReadPosRankSum=1.192;SOR=3.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:110,0,499
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19	20395192	20395192	C	A	263.77	PASS	ENSG00000231205	ncRNA_intronic	ENST00000541160;ENST00000542380	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:292,0,208
19	20395493	20395493	T	C	434.77	PASS	ENSG00000231205	ncRNA_intronic	ENST00000541160;ENST00000542380	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.98;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:463,45,0
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19	20395858	20395858	T	C	311.77	PASS	ENSG00000231205	ncRNA_intronic	ENST00000541160;ENST00000542380	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.98;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:40:340,0,40
19	20396128	20396128	T	C	231.8	PASS	ENSG00000231205	ncRNA_exonic	ENST00000615684	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.11;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:260,21,0
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19	20397229	20397229	A	G	336.77	PASS	ENSG00000231205	ncRNA_exonic	ENST00000615684	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.454;SOR=1.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:365,0,127
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19	20421750	20421750	C	T	21.77	PASS	ENSG00000231205	ncRNA_intronic	ENST00000541160;ENST00000542380;ENST00000596724;ENST00000597334;ENST00000600513;ENST00000615684	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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19	23867246	23867246	A	T	142.77	PASS	ENSG00000267924	ncRNA_intronic	ENST00000599944	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.55;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=0.074	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:171,0,176
19	23867460	23867460	A	G	313.78	PASS	ENSG00000267924	ncRNA_intronic	ENST00000599944	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.86;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
19	23867687	23867687	G	A	168.9	PASS	ENSG00000267924	ncRNA_intronic	ENST00000599944	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.78;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
19	23867716	23867716	G	A	347.78	PASS	ENSG00000267924	ncRNA_intronic	ENST00000599944	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.22;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
19	23867832	23867832	A	C	27.77	PASS	ENSG00000267924	ncRNA_intronic	ENST00000599944	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:56:56,0,76
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19	23871019	23871019	G	A	1110.77	PASS	ENSG00000267924	ncRNA_intronic	ENST00000599944	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.9;SOR=2.621	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:89:1139,89,0
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19	23934878	23934878	C	T	56.74	PASS	ENSG00000269289	ncRNA_intronic	ENST00000596326	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	23942485	23942485	G	A	139.03	PASS	ENSG00000269289	ncRNA_intronic	ENST00000596326	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	24038238	24038238	T	C	21.8	PASS	ENSG00000268362,ENSG00000213096	ncRNA_intronic	ENST00000594934;ENST00000597683	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:50:50,0,188
19	24061458	24061458	C	G	63.28	PASS	ENSG00000213096,ENSG00000268362	ncRNA_intronic	ENST00000594934;ENST00000597683	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
19	24064630	24064630	A	G	50.77	PASS	ENSG00000268362	ncRNA_exonic	ENST00000597683	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
19	24064801	24064801	A	G	84.77	PASS	ENSG00000268362,ENSG00000213096	ncRNA_intronic	ENST00000594934;ENST00000597683	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
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19	28679022	28679022	T	C	21.77	PASS	ENSG00000267243	ncRNA_intronic	ENST00000592347	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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19	46401361	46401361	T	C	55.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478046;ENST00000307522	dist=8380;dist=9011	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.39;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:84:84,0,283
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19	46401543	46401543	G	A	180.9	PASS	.	intergenic	ENST00000478046;ENST00000307522	dist=8562;dist=8829	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.52;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
19	46402226	46402226	G	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000478046;ENST00000307522	dist=9245;dist=8146	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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19	46407426	46407426	T	C	102.77	PASS	.	intergenic	ENST00000478046;ENST00000307522	dist=14445;dist=2946	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,286
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19	46410134	46410134	T	C	52.8	PASS	.	downstream	ENST00000307522	dist=238	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.6;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:81,0,21
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19	46526977	46526977	T	C	146.9	PASS	ENSG00000230510	exonic	ENST00000414155;ENST00000593359;ENST00000602017	.	synonymous SNV	ENSG00000230510:ENST00000414155:exon2:c.A183G:p.A61A	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.38;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
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2	8667859	8667859	T	C	301.78	PASS	ENSG00000235092	ncRNA_intronic	ENST00000412712	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.53;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:330,27,0
2	8668170	8668170	G	A	105.03	PASS	ENSG00000235092	ncRNA_intronic	ENST00000412712	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
2	8668315	8668315	A	G	59.74	PASS	ENSG00000235092	ncRNA_intronic	ENST00000412712	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	8668931	8668931	C	T	105.03	PASS	ENSG00000235092	ncRNA_intronic	ENST00000412712	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
2	8669882	8669882	C	T	56.74	PASS	ENSG00000235092	ncRNA_intronic	ENST00000412712	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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2	10187602	10187602	A	C	56.74	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	10187957	10187957	C	T	97.28	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	10189899	10189899	C	T	97.28	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	10189955	10189955	T	C	105.03	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
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2	10198059	10198059	C	T	63.28	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
2	10198734	10198734	G	A	134.9	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.98;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:163,15,0
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2	10204600	10204600	C	T	305.78	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.27;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
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2	10207611	10207611	T	C	237.78	PASS	ENSG00000163009	ncRNA_intronic	ENST00000381786;ENST00000619640	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.72;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:266,24,0
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2	10214357	10214357	C	T	51.74	PASS	.	intergenic	ENST00000381786;ENST00000582099	dist=2632;dist=66271	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.87;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
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2	10217619	10217619	G	C	180.9	PASS	.	intergenic	ENST00000381786;ENST00000582099	dist=5894;dist=63009	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.46;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
2	10217692	10217692	T	C	180.9	PASS	.	intergenic	ENST00000381786;ENST00000582099	dist=5967;dist=62936	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.97;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
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2	105336604	105336604	T	C	66.77	PASS	ENSG00000272994	ncRNA_exonic	ENST00000610036	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.084;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:95:95,0,250
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2	106404725	106404725	T	G	50.77	PASS	ENSG00000153165	intronic	ENST00000304514	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
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2	106436135	106436135	G	A	21.77	PASS	ENSG00000153165	exonic	ENST00000304514;ENST00000409886	.	synonymous SNV	ENSG00000153165:ENST00000304514:exon12:c.C1746T:p.C582C,ENSG00000153165:ENST00000409886:exon12:c.C1746T:p.C582C	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
2	106457013	106457013	T	A	139.03	PASS	ENSG00000153165	exonic	ENST00000304514;ENST00000409886	.	synonymous SNV	ENSG00000153165:ENST00000304514:exon4:c.A363T:p.A121A,ENSG00000153165:ENST00000409886:exon4:c.A363T:p.A121A	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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2	106697387	106697387	T	C	21.77	PASS	ENSG00000214199	ncRNA_exonic	ENST00000443590	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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2	108432501	108432501	A	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000603004;ENST00000309863	dist=8616;dist=16060	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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2	108483409	108483409	G	A	50.77	PASS	ENSG00000135968	intronic	ENST00000309863;ENST00000393321;ENST00000482325	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=0;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
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2	113257124	113257124	A	C	244.77	PASS	ENSG00000189223,ENSG00000125618	ncRNA_intronic	ENST00000333145;ENST00000422956;ENST00000436293;ENST00000445745;ENST00000451179;ENST00000510859;ENST00000553869;ENST00000556070;ENST00000609210;ENST00000616073;ENST00000617509;ENST00000623306	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.4;ReadPosRankSum=-1.15;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:90:273,0,90
2	113258115	113258115	C	G	105.77	PASS	ENSG00000189223,ENSG00000125618	ncRNA_intronic	ENST00000333145;ENST00000422956;ENST00000436293;ENST00000445745;ENST00000451179;ENST00000510859;ENST00000553869;ENST00000556070;ENST00000609210;ENST00000616073;ENST00000617509;ENST00000623306	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.473;SOR=1.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:134,0,227
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2	113597909	113597909	C	T	34.77	PASS	ENSG00000146556	ncRNA_intronic	ENST00000453662;ENST00000538033	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.812;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,288
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2	113597990	113597990	G	T	34.77	PASS	ENSG00000146556	ncRNA_intronic	ENST00000453662;ENST00000538033	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.792;SOR=2.2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,156
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2	113598421	113598421	C	G	125.77	PASS	ENSG00000146556	ncRNA_exonic	ENST00000453662;ENST00000538033	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.672;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.1;ReadPosRankSum=2.442;SOR=0.243	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,8:60:99:154,0,1727
2	113598662	113598662	T	C	473.77	PASS	ENSG00000146556	ncRNA_exonic	ENST00000453662;ENST00000538033	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,18:83:99:502,0,2176
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2	113607665	113607665	C	T	51.77	PASS	ENSG00000279267	ncRNA_exonic	ENST00000623707	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:80:80,0,354
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2	113612069	113612069	C	A	87.77	QD	ENSG00000240356	ncRNA_exonic	ENST00000391616;ENST00000416673;ENST00000449021	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=20.381;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=4.388	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,9:94:99:116,0,4002
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2	113613417	113613417	C	T	21.77	PASS	ENSG00000240356	ncRNA_intronic	ENST00000391616;ENST00000416673	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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2	113642619	113642619	A	G	85.77	PASS	ENSG00000144134	UTR3	ENST00000393167;ENST00000409842;ENST00000409875;ENST00000450954;ENST00000452831	ENST00000393167:c.*490A>G;ENST00000409842:c.*490A>G;ENST00000409875:c.*490A>G;ENST00000450954:c.*792A>G;ENST00000452831:c.*899A>G	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.506;SOR=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,5:32:99:114,0,764
2	113662148	113662148	T	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000272567;ENST00000419351	dist=3473;dist=5330	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
2	113702836	113702836	C	T	188.84	PASS	ENSG00000227359	ncRNA_intronic	ENST00000424612	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.47;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
2	113702940	113702940	T	C	139.03	PASS	ENSG00000227359	ncRNA_intronic	ENST00000424612	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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2	118781375	118781375	T	C	255.77	SnpCluster	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=594989;dist=52325	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:284,0,416
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2	118782256	118782256	A	G	1486.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=595870;dist=51444	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.52;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1515,117,0
2	118783062	118783062	A	G	72.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=596676;dist=50638	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.642;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:101,0,651
2	118783256	118783256	T	G	1227.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=596870;dist=50444	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.27;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1256,96,0
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2	118783459	118783459	C	T	114.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=597073;dist=50241	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.64;SOR=1.46	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:143,0,564
2	118783747	118783747	C	T	609.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=597361;dist=49953	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.39;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.76	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,19:25:99:638,0,137
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2	118786047	118786047	A	G	460.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=599661;dist=47653	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.07;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:489,36,0
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2	118786247	118786247	C	T	77.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414886;ENST00000584273	dist=599861;dist=47453	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.21;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:106,0,182
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2	131513514	131513514	A	G	131.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=11.698;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.277;SOR=3.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,6:29:99:160,0,901
2	131513528	131513528	A	G	427.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.785;SOR=1.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:456,0,272
2	131513744	131513744	A	G	135.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.9;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.2;SOR=0.275	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,6:29:99:164,0,748
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2	131513809	131513809	A	G	201.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=1.23	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:230,0,490
2	131513824	131513824	A	G	627.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:65:656,0,65
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2	131513909	131513909	A	G	56.77	QD;SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=7.92;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.267;SOR=2.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,6:53:85:85,0,1814
2	131513929	131513929	A	G	646.77	SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.04;ReadPosRankSum=-1.471;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,20:43:99:675,0,792
2	131513940	131513940	A	G	1024.77	SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.01;ReadPosRankSum=-1.127;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,31:64:99:1053,0,1163
2	131513959	131513959	A	G	1213.77	SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=0;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=14.604;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.729;SOR=2.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,37:67:99:1242,0,837
2	131514301	131514301	T	C	864.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=11.541;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.6;ReadPosRankSum=1.719;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,34:131:99:893,0,3072
2	131514484	131514484	C	G	631.77	SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=6.61;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,24:76:99:660,0,1671
2	131514510	131514510	A	G	170.77	SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.2;ReadPosRankSum=2.188;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:199,0,375
2	131514511	131514511	A	G	489.77	SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=34.98;ReadPosRankSum=1.098;SOR=0.76	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:40:518,0,40
2	131514514	131514514	A	G	51.77	QD;SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:80:80,0,939
2	131514546	131514546	A	G	2004.77	SnpCluster	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=9.907;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=1.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,42:50:99:2033,0,157
2	131514554	131514554	A	G	1139.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=14.243;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,33:65:99:1168,0,1202
2	131514880	131514880	A	G	242.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.27;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,15:107:99:271,0,3278
2	131514898	131514898	A	G	2143.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.31;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,64:111:99:2172,0,1392
2	131514936	131514936	A	G	98.77	QD	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=0.82;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,12:121:99:127,0,3599
2	131514970	131514970	A	G	3359.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;MQRankSum=0;QD=35;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,90:96:93:3388,93,0
2	131514986	131514986	A	G	1143.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=16.319;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.091;SOR=1.522	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,37:102:99:1172,0,2021
2	131517770	131517770	G	T	1508.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_exonic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=2.903;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.209;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,53:179:99:1537,0,4299
2	131517823	131517823	T	C	1943.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_exonic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=3.814;ClippingRankSum=0;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.934;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,62:191:99:1972,0,4127
2	131518185	131518185	C	T	47.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_intronic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.18;ReadPosRankSum=0;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:76:76,0,348
2	131520389	131520389	T	C	2433.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_exonic	ENST00000415574;ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=0;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=3.807;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.944	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,82:271:99:2462,0,6228
2	131520545	131520545	C	T	1719.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_exonic	ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=11.248;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.973;SOR=1.379	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,62:246:99:1748,0,6061
2	131520603	131520603	T	G	1649.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_exonic	ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.112;SOR=1.029	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,62:242:99:1678,0,6164
2	131520846	131520846	G	A	2290.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_exonic	ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.98;ClippingRankSum=0;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,81:239:99:2319,0,5346
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2	131521473	131521473	G	T	633.77	PASS	ENSG00000152117	ncRNA_exonic	ENST00000438378	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=4.484;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.505;SOR=1.54	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,26:115:99:662,0,2805
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2	131698982	131698982	C	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000431979;ENST00000624391	dist=49367;dist=23393	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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2	132654383	132654383	G	C	21.77	PASS	ENSG00000150551	intronic	ENST00000345008;ENST00000397463	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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2	134139152	134139152	A	C	21.77	PASS	ENSG00000152127	intronic	ENST00000409645	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
2	134162273	134162273	A	G	63.28	PASS	ENSG00000152127	intronic	ENST00000409645	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
2	134295546	134295546	G	C	21.77	PASS	ENSG00000152127	intronic	ENST00000281923;ENST00000409645	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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2	173232378	173232378	A	G	215.77	PASS	ENSG00000091436,ENSG00000238133	exonic	ENST00000375213;ENST00000409176	.	synonymous SNV	ENSG00000091436:ENST00000375213:exon14:c.A1122G:p.T374T,ENSG00000091436:ENST00000409176:exon14:c.A1122G:p.T374T	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:244,0,260
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2	173293472	173293472	A	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000423106;ENST00000433054	dist=11436;dist=4157	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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2	173354390	173354390	C	G	180.9	PASS	ENSG00000236391	ncRNA_intronic	ENST00000437243	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.08;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
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20	21385622	21385622	T	C	237.78	PASS	ENSG00000088930	intronic	ENST00000377191	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.72;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:266,24,0
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20	21388294	21388294	G	T	56.74	PASS	ENSG00000088930	intronic	ENST00000377191	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	22404679	22404679	G	A	21.77	PASS	ENSG00000204684	ncRNA_intronic	ENST00000377121	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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20	24932915	24932915	G	T	379.77	PASS	ENSG00000274173	ncRNA_exonic	ENST00000620459	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.19;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:408,0,620
20	24955112	24955112	T	C	97.28	PASS	ENSG00000077984	intronic	ENST00000480798	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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21	9069497	9069497	A	G	4698.77	PASS	ENSG00000188681	ncRNA_exonic	ENST00000416067;ENST00000559466	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=35.02;SOR=1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:4727,343,0
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21	14096321	14096321	G	A	56.74	PASS	ENSG00000224905	ncRNA_intronic	ENST00000428809;ENST00000432621	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	14096393	14096393	T	C	237.78	PASS	ENSG00000224905	ncRNA_intronic	ENST00000428809;ENST00000432621	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.72;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:266,24,0
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21	14383028	14383028	T	C	123.78	PASS	ENSG00000155304	intronic	ENST00000285667	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:152,0,27
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21	15044253	15044253	T	G	56.74	PASS	ENSG00000180530	intronic	ENST00000318948;ENST00000400199;ENST00000400202	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	15044490	15044490	G	A	56.74	PASS	ENSG00000180530	intronic	ENST00000318948;ENST00000400199;ENST00000400202	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	15369333	15369333	T	A	237.78	PASS	.	intergenic	ENST00000623768;ENST00000449602	dist=22595;dist=1189	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.72;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:266,24,0
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21	15400663	15400663	C	T	97.28	PASS	ENSG00000229425	ncRNA_intronic	ENST00000449602	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
21	15440893	15440893	T	C	44.74	PASS	.	intergenic	ENST00000449602;ENST00000450823	dist=38588;dist=49637	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
21	15444732	15444732	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000449602;ENST00000450823	dist=42427;dist=45798	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	15461687	15461687	C	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000449602;ENST00000450823	dist=59382;dist=28843	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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21	16298454	16298454	A	G	21.77	PASS	ENSG00000270071,ENSG00000215386	ncRNA_intronic	ENST00000400178;ENST00000419952;ENST00000428669;ENST00000445461;ENST00000456342;ENST00000602505;ENST00000602580;ENST00000602901;ENST00000602921;ENST00000602935;ENST00000619222	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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21	41524462	41524462	G	C	21.77	PASS	ENSG00000184012	intronic	ENST00000454499	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
21	41525000	41525000	G	A	84.77	PASS	ENSG00000184012	intronic	ENST00000454499	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
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21	41688514	41688514	A	G	97.28	PASS	ENSG00000227702	ncRNA_intronic	ENST00000413718	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
21	41700753	41700753	C	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000413718;ENST00000412102	dist=3417;dist=10767	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	41701923	41701923	C	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000413718;ENST00000412102	dist=4587;dist=9597	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
21	41702335	41702335	C	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000413718;ENST00000412102	dist=4999;dist=9185	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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21	41705547	41705547	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000413718;ENST00000412102	dist=8211;dist=5973	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	41706656	41706656	T	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000413718;ENST00000412102	dist=9320;dist=4864	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	41739855	41739855	C	T	2742.77	PASS	ENSG00000236883	ncRNA_intronic	ENST00000423276	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.438	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,86:106:99:2771,0,443
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22	16640489	16640489	A	G	21.77	PASS	ENSG00000100181	ncRNA_exonic	ENST00000588424	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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22	16655986	16655986	A	G	22.79	PASS	ENSG00000249263,ENSG00000100181,ENSG00000189295	ncRNA_intronic	ENST00000456726;ENST00000510265;ENST00000558085	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.07;ReadPosRankSum=-1.922;SOR=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:51:51,0,228
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22	16656720	16656720	A	G	35.77	PASS	ENSG00000189295,ENSG00000100181,ENSG00000249263	ncRNA_intronic	ENST00000456726;ENST00000510265;ENST00000558085	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.803;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:64:64,0,189
22	16656997	16656997	A	G	38.77	PASS	ENSG00000100181,ENSG00000249263,ENSG00000189295	ncRNA_intronic	ENST00000456726;ENST00000510265;ENST00000558085	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:67:67,0,181
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22	38341264	38341264	T	C	87.77	PASS	ENSG00000244627,ENSG00000213923	ncRNA_intronic	ENST00000428294;ENST00000428606	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.927;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:116,0,574
22	38341266	38341266	T	C	309.77	PASS	ENSG00000244627,ENSG00000213923	ncRNA_intronic	ENST00000428294;ENST00000428606	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=1.255	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:338,0,247
22	38341365	38341365	T	C	52.77	PASS	ENSG00000213923,ENSG00000244627	ncRNA_intronic	ENST00000428294;ENST00000428606	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:81:81,0,397
22	38341419	38341419	T	C	90.77	PASS	ENSG00000213923,ENSG00000244627	ncRNA_intronic	ENST00000428294;ENST00000428606	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:119,0,411
22	38341456	38341456	T	C	72.77	PASS	ENSG00000213923,ENSG00000244627	ncRNA_intronic	ENST00000428294;ENST00000428606	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.605;SOR=1.23	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:101,0,450
22	38341600	38341600	T	C	68.77	PASS	ENSG00000213923,ENSG00000244627	ncRNA_intronic	ENST00000428294;ENST00000428606	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=14.052;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.13;ReadPosRankSum=1.137;SOR=1.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:97:97,0,562
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22	38348722	38348722	T	G	185.8	PASS	ENSG00000244627,ENSG00000213923	ncRNA_intronic	ENST00000407491;ENST00000428294;ENST00000443042	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.54;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:214,21,0
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22	38350740	38350740	C	A	66.77	QD	ENSG00000244627	ncRNA_exonic	ENST00000457665	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.76;ReadPosRankSum=1.598;SOR=0.85	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,5:38:95:95,0,1037
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22	38352949	38352949	T	C	102.77	PASS	ENSG00000213923,ENSG00000244627	ncRNA_intronic	ENST00000407491;ENST00000428294;ENST00000443042;ENST00000457665	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.56;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=1.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,232
22	38352993	38352993	T	C	90.77	PASS	ENSG00000213923,ENSG00000244627	ncRNA_intronic	ENST00000407491;ENST00000428294;ENST00000443042;ENST00000457665	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.26	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:119,0,385
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3	146057722	146057722	C	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000494509;ENST00000567714	dist=94099;dist=1863	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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3	158750653	158750653	A	G	218.84	PASS	ENSG00000240207,ENSG00000118855	ncRNA_intronic	ENST00000465477;ENST00000468242	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.91;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
3	158754187	158754187	C	G	97.28	PASS	ENSG00000118855,ENSG00000240207	ncRNA_intronic	ENST00000465477;ENST00000468242	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	158757846	158757846	T	G	81.77	PASS	ENSG00000118855,ENSG00000240207	ncRNA_intronic	ENST00000465477;ENST00000468242	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=0;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:110,0,68
3	158757861	158757861	A	G	81.77	PASS	ENSG00000118855,ENSG00000240207	ncRNA_intronic	ENST00000465477;ENST00000468242	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=0;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:110,0,68
3	158759073	158759073	A	G	56.74	PASS	ENSG00000118855,ENSG00000240207	ncRNA_intronic	ENST00000465477;ENST00000468242	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	158760066	158760066	A	G	56.74	PASS	ENSG00000240207,ENSG00000118855	ncRNA_intronic	ENST00000465477;ENST00000468242	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	158760787	158760787	C	T	63.28	PASS	ENSG00000118855,ENSG00000240207	ncRNA_intronic	ENST00000465477;ENST00000468242	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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3	161888521	161888521	C	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=66613;dist=598020	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	161888601	161888601	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=66693;dist=597940	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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3	161898797	161898797	T	C	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=76889;dist=587744	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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3	162049763	162049763	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=227855;dist=436778	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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3	162075844	162075844	A	G	42.77	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=253936;dist=410697	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.666;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:71:71,0,470
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3	162109972	162109972	C	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=288064;dist=376569	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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3	162112854	162112854	C	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=290946;dist=373687	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	162115978	162115978	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000497285;ENST00000465035	dist=294070;dist=370563	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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3	195687866	195687866	G	A	1176.77	PASS	ENSG00000242086	ncRNA_exonic	ENST00000597482;ENST00000598992	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=3.29;ClippingRankSum=0;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=20.781;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.614;SOR=2.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,37:91:99:1205,0,1979
3	195687877	195687877	C	A	926.77	PASS	ENSG00000242086	ncRNA_exonic	ENST00000597482;ENST00000598992	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=12.28;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,36:103:99:955,0,2452
3	195687905	195687905	C	T	1141.77	PASS	ENSG00000242086	ncRNA_exonic	ENST00000597482;ENST00000598992	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=12.515;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.884;SOR=1.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,37:91:99:1170,0,1731
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3	195964529	195964529	T	C	1196.77	PASS	ENSG00000185485	ncRNA_intronic	ENST00000354559;ENST00000427149;ENST00000427841;ENST00000440850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,41:73:99:1225,0,928
3	195964698	195964698	C	T	1054.77	PASS	ENSG00000185485	ncRNA_intronic	ENST00000354559;ENST00000427149;ENST00000427841;ENST00000440850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.85;ClippingRankSum=0;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.74;SOR=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,35:88:99:1083,0,1605
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3	195967405	195967405	A	T	733.85	SnpCluster	ENSG00000185485	ncRNA_intronic	ENST00000354559;ENST00000427149;ENST00000427841;ENST00000440850	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=0;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;MQRankSum=0;QD=33.36;ReadPosRankSum=2.283;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,20:22:17:762,17,0
3	195967589	195967589	T	C	349.77	FS;QD	ENSG00000185485	ncRNA_exonic	ENST00000354559;ENST00000427841;ENST00000440850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=34.961;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.43;ReadPosRankSum=1.717;SOR=4.975	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,11:244:99:378,0,14330
3	195967594	195967594	T	C	361.77	FS;QD	ENSG00000185485	ncRNA_exonic	ENST00000354559;ENST00000427841;ENST00000440850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=83.296;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.41;ReadPosRankSum=-3.985;SOR=6.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,27:256:99:390,0,14211
3	195967882	195967882	G	A	694.77	FS	ENSG00000185485	ncRNA_exonic	ENST00000354559;ENST00000427841;ENST00000440850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=51.538;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.359;SOR=4.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,31:186:99:723,0,5614
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3	195969535	195969535	T	G	858.77	PASS	ENSG00000185485	ncRNA_intronic	ENST00000427841;ENST00000440850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=5.079;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.79;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,29:66:99:887,0,1135
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3	195975750	195975750	G	A	1138.77	PASS	ENSG00000185485	ncRNA_exonic	ENST00000427841;ENST00000440850;ENST00000457601	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=5.314;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.58;ReadPosRankSum=2.286;SOR=0.34	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,42:173:99:1167,0,4317
3	195975768	195975768	C	T	1099.77	PASS	ENSG00000185485	ncRNA_exonic	ENST00000427841;ENST00000440850;ENST00000457601	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=10.191;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.75;ReadPosRankSum=2.47;SOR=0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,39:163:99:1128,0,4241
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3	196973544	196973544	A	G	43.77	PASS	.	intergenic	ENST00000443835;ENST00000445739	dist=4673;dist=10346	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
3	196991284	196991284	C	A	75.77	PASS	ENSG00000163975	intergenic	ENST00000456555;ENST00000424769	dist=3726;dist=8176	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.068;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,112
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3	196993161	196993161	G	A	52.77	PASS	ENSG00000163975	intergenic	ENST00000456555;ENST00000424769	dist=5603;dist=6299	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:81,0,75
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4	217759	217759	T	C	146.9	PASS	ENSG00000198155	ncRNA_intronic	ENST00000356347	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.38;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
4	217856	217856	G	A	93.03	PASS	ENSG00000198155	ncRNA_intronic	ENST00000356347	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=23.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:121,12,0
4	218419	218419	A	G	30.77	PASS	ENSG00000198155	ncRNA_intronic	ENST00000356347	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,192
4	220675	220675	C	G	180.9	PASS	ENSG00000198155	ncRNA_intronic	ENST00000356347;ENST00000398732	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.9;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
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4	222634	222634	T	C	229.8	PASS	ENSG00000198155	ncRNA_intronic	ENST00000356347;ENST00000398732	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.83;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:258,21,0
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4	256755	256755	G	A	305.78	PASS	.	downstream	ENST00000356347	dist=770	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=24.42;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
4	257142	257142	T	C	42.77	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=1157;dist=11840	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
4	257627	257627	A	T	187.84	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=1642;dist=11355	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.31;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:216,18,0
4	258712	258712	C	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=2727;dist=10270	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	259015	259015	G	A	343.77	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=3030;dist=9967	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.38;SOR=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:372,30,0
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4	259209	259209	C	G	210.84	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=3224;dist=9773	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.41;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
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4	263190	263190	A	G	193.9	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=7205;dist=5792	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
4	263529	263529	G	A	347.78	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=7544;dist=5453	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.92;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
4	264723	264723	A	G	217.8	PASS	.	intergenic	ENST00000356347;ENST00000511111	dist=8738;dist=4259	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.11;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:246,21,0
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4	9039505	9039505	T	C	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000442655;ENST00000506029	dist=8439;dist=12337	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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4	127063167	127063167	A	G	389.77	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.24;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
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4	127065260	127065260	T	G	514.77	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.32;SOR=1.911	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:543,45,0
4	127065398	127065398	C	T	127.03	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
4	127065412	127065412	T	C	56.74	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	127065882	127065882	T	C	239.78	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.97;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:268,24,0
4	127066565	127066565	C	T	180.9	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.32;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
4	127066635	127066635	T	G	315.78	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.56;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:344,27,0
4	127067126	127067126	C	A	438.77	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.31;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:467,36,0
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4	127068084	127068084	T	G	460.77	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.52;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:489,36,0
4	127068229	127068229	C	T	335.78	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.71;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
4	127068250	127068250	C	T	239.8	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.26;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:268,21,0
4	127068267	127068267	A	G	293.78	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.55;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:322,24,0
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4	127071448	127071448	A	C	21.77	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
4	127072440	127072440	G	A	56.74	PASS	ENSG00000250945	ncRNA_intronic	ENST00000506852	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	127082561	127082561	A	C	210.84	PASS	.	intergenic	ENST00000506852;ENST00000513519	dist=4799;dist=14330	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.85;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
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4	127087977	127087977	T	C	51.77	PASS	.	intergenic	ENST00000506852;ENST00000513519	dist=10215;dist=8914	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:80:80,0,443
4	127087988	127087988	T	C	147.77	PASS	.	intergenic	ENST00000506852;ENST00000513519	dist=10226;dist=8903	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=0;SOR=0.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:176,0,217
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4	127221407	127221407	A	G	139.03	PASS	ENSG00000248491	ncRNA_intronic	ENST00000504050	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
4	127222088	127222088	C	T	97.28	PASS	ENSG00000248491	ncRNA_intronic	ENST00000504050	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
4	127222405	127222405	G	C	139.03	PASS	ENSG00000248491	ncRNA_intronic	ENST00000504050	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
4	127222879	127222879	T	C	44.74	PASS	ENSG00000248491	ncRNA_intronic	ENST00000504050	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
4	127228581	127228581	C	T	271.78	PASS	ENSG00000248491	ncRNA_intronic	ENST00000504050	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.97;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:300,24,0
4	127228846	127228846	A	G	551.77	PASS	ENSG00000248491	ncRNA_intronic	ENST00000504050	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.98;SOR=1.112	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:580,45,0
4	127229177	127229177	T	C	512.77	PASS	ENSG00000248491	ncRNA_intronic	ENST00000504050	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.93;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:541,42,0
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4	128484414	128484414	T	C	21.77	PASS	ENSG00000251432	ncRNA_intronic	ENST00000511497	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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4	128507209	128507209	T	C	21.77	PASS	ENSG00000251432	ncRNA_intronic	ENST00000511497	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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4	173376775	173376775	G	C	837.77	PASS	ENSG00000164105	intronic	ENST00000296504	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.91;SOR=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:866,72,0
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4	183464823	183464823	T	C	75.77	PASS	.	intergenic	ENST00000504169;ENST00000394154	dist=16625;dist=18667	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,134
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4	183492067	183492067	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000394154;ENST00000457303	dist=7882;dist=2871	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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4	183502020	183502020	T	C	39.77	PASS	ENSG00000232648	ncRNA_intronic	ENST00000457303	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,110
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4	185000352	185000352	G	A	241.77	PASS	ENSG00000248517	ncRNA_intronic	ENST00000505053	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:270,0,162
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4	185014105	185014105	T	C	180.9	PASS	.	intergenic	ENST00000505053;ENST00000515777	dist=8919;dist=4736	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=24.61;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
4	185014467	185014467	A	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000505053;ENST00000515777	dist=9281;dist=4374	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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4	185190957	185190957	G	A	2644.77	PASS	ENSG00000164323	exonic	ENST00000458385;ENST00000503223;ENST00000514798	.	synonymous SNV	ENSG00000164323:ENST00000458385:exon2:c.C240T:p.P80P,ENSG00000164323:ENST00000514798:exon2:c.C240T:p.P80P,ENSG00000164323:ENST00000503223:exon3:c.C240T:p.P80P	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,84:133:99:2673,0,1526
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4	185366851	185366851	T	C	62.74	PASS	ENSG00000109771	UTR3	ENST00000328559	ENST00000328559:c.*329A>G	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	185366856	185366856	T	C	62.74	PASS	ENSG00000109771	UTR3	ENST00000328559	ENST00000328559:c.*324A>G	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	185381412	185381412	C	G	51.28	PASS	ENSG00000250410	ncRNA_intronic	ENST00000514884	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=17.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:79,9,0
4	185387931	185387931	A	C	139.03	PASS	ENSG00000250410	ncRNA_intronic	ENST00000514884	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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5	1583170	1583170	T	C	239.78	PASS	ENSG00000185986	ncRNA_intronic	ENST00000515467	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.97;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:268,24,0
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5	1585239	1585239	C	T	56.74	PASS	ENSG00000185986	ncRNA_intronic	ENST00000515467	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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5	3606170	3606170	C	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000302006;ENST00000408268	dist=4767;dist=113525	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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5	21586687	21586687	A	T	237.78	PASS	ENSG00000183666	ncRNA_exonic	ENST00000607545	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.72;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:266,24,0
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5	101760311	101760311	C	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000577858;ENST00000513483	dist=178183;dist=56164	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	101782779	101782779	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000577858;ENST00000513483	dist=200651;dist=33696	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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5	136055685	136055685	C	T	362.77	PASS	ENSG00000120708	exonic	ENST00000442011;ENST00000514554	.	synonymous SNV	ENSG00000120708:ENST00000442011:exon11:c.C1416T:p.L472L	AC=2;AF=1;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.98;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:391,33,0
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5	141247222	141247222	A	C	139.03	PASS	ENSG00000113248	exonic	ENST00000231173	.	synonymous SNV	ENSG00000113248:ENST00000231173:exon1:c.A1644C:p.R548R	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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5	181323198	181323198	C	G	56.74	PASS	ENSG00000238035	ncRNA_intronic	ENST00000499986;ENST00000604354	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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5	181327055	181327055	A	G	84.84	PASS	.	intergenic	ENST00000604354;ENST00000622706	dist=2370;dist=1994	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.15;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.21;ReadPosRankSum=0;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:18:113,0,18
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6	821705	821705	T	C	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000607084;ENST00000620188	dist=41057;dist=83740	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	1512656	1512656	C	A	107.28	PASS	.	intergenic	ENST00000466002;ENST00000404600	dist=5058;dist=1042	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.02;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
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6	1513387	1513387	T	G	263.8	PASS	.	downstream	ENST00000404600	dist=311	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.91;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
6	1513879	1513879	T	C	355.77	PASS	ENSG00000218027	ncRNA_exonic	ENST00000404600	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.25;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:384,30,0
6	1514132	1514132	A	G	180.9	PASS	ENSG00000218027	ncRNA_exonic	ENST00000404600	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.86;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
6	1514564	1514564	C	T	100.77	PASS	ENSG00000218027	ncRNA_exonic	ENST00000404600	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=14.4;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:70:129,0,70
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6	1520301	1520301	A	C	148.9	PASS	.	intergenic	ENST00000404600;ENST00000607350	dist=5012;dist=8063	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.78;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:177,15,0
6	1520806	1520806	A	G	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000404600;ENST00000607350	dist=5517;dist=7558	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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6	1521975	1521975	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000404600;ENST00000607350	dist=6686;dist=6389	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	1522910	1522910	C	G	63.28	PASS	.	intergenic	ENST00000404600;ENST00000607350	dist=7621;dist=5454	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
6	1524101	1524101	T	C	123.77	PASS	.	intergenic	ENST00000404600;ENST00000607350	dist=8812;dist=4263	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:152,0,103
6	1527799	1527799	C	T	21.8	QD	.	downstream	ENST00000607350	dist=565	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,272
6	1528441	1528441	C	A	28.77	PASS	ENSG00000272279	ncRNA_exonic	ENST00000607350	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,650
6	1528446	1528446	T	A	28.77	PASS	ENSG00000272279	ncRNA_exonic	ENST00000607350	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,650
6	1528724	1528724	A	T	184.77	PASS	ENSG00000272279	ncRNA_exonic	ENST00000607350	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,8:29:99:213,0,790
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6	2616383	2616383	G	C	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000624609;ENST00000624527	dist=52240;dist=5530	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	2617649	2617649	T	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000624609;ENST00000624527	dist=53506;dist=4264	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	2619616	2619616	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000624609;ENST00000624527	dist=55473;dist=2297	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	2620162	2620162	G	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000624609;ENST00000624527	dist=56019;dist=1751	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	2622416	2622416	A	C	179.77	PASS	ENSG00000164385	ncRNA_exonic	ENST00000624527	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.02;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.152;SOR=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:208,0,258
6	2622677	2622677	C	T	248.77	PASS	ENSG00000164385	ncRNA_exonic	ENST00000624527	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.45;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:277,0,247
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6	12288960	12288960	G	A	49.77	PASS	.	intergenic	ENST00000379388;ENST00000379375	dist=123961;dist=1403	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,155
6	12294025	12294025	A	G	997.77	PASS	ENSG00000078401	exonic	ENST00000379375	.	synonymous SNV	ENSG00000078401:ENST00000379375:exon3:c.A318G:p.E106E	AC=2;AF=1;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.95;SOR=2.387	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1026,81,0
6	12514451	12514451	G	A	71.03	PASS	ENSG00000212802	ncRNA_exonic	ENST00000391491	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=17.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:99,12,0
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6	13267009	13267009	T	C	97.28	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000606627	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	13267706	13267706	T	C	105.03	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_exonic	ENST00000606627	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
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6	13275682	13275682	G	C	56.74	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	13275718	13275718	C	T	56.74	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	13276183	13276183	A	G	23.76	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=11.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
6	13276537	13276537	T	C	56.74	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	13276797	13276797	T	A	21.77	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	13277482	13277482	G	C	55.74	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	13278416	13278416	A	G	139.03	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	13279199	13279199	A	G	97.28	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	13279232	13279232	G	A	46.77	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000399446	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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6	13279674	13279674	G	T	347.78	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_exonic	ENST00000606150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.29;SOR=3.056	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
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6	13280222	13280222	G	A	57.77	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_exonic	ENST00000606150	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:86:86,0,276
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6	13280409	13280409	T	C	537.77	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_exonic	ENST00000606150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.61;SOR=1.244	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:566,48,0
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6	13280632	13280632	G	A	325.78	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_exonic	ENST00000606150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.41;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
6	13280634	13280634	G	A	325.78	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_exonic	ENST00000606150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.31;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
6	13280726	13280726	G	A	421.77	PASS	ENSG00000215022	ncRNA_exonic	ENST00000606150	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:450,36,0
6	13281396	13281396	A	C	40.77	PASS	ENSG00000112137,ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000399446;ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,76
6	13281835	13281835	C	T	72.77	PASS	ENSG00000145979,ENSG00000215022,ENSG00000112137	ncRNA_intronic	ENST00000399446;ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:101,0,30
6	13288193	13288193	C	A	56.74	PASS	ENSG00000112137,ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	13288303	13288303	C	T	97.28	PASS	ENSG00000145979,ENSG00000215022,ENSG00000112137	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	13288346	13288346	G	A	97.28	PASS	ENSG00000112137,ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	13289090	13289090	C	T	108.77	PASS	ENSG00000215022,ENSG00000112137,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:137,0,186
6	13290006	13290006	T	C	105.03	PASS	ENSG00000145979,ENSG00000112137,ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
6	13290778	13290778	G	A	152.03	PASS	ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.02;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	13290783	13290783	A	G	192.9	PASS	ENSG00000145979,ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.63;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
6	13291129	13291129	A	C	27.77	PASS	ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:56:56,0,248
6	13291328	13291328	C	T	159.77	PASS	ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.068;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:188,0,62
6	13291844	13291844	A	G	272.77	PASS	ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.8;ReadPosRankSum=-2.744;SOR=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:92:301,0,92
6	13291920	13291920	C	G	139.03	PASS	ENSG00000215022,ENSG00000145979	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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6	13292282	13292282	G	A	147.77	PASS	ENSG00000145979,ENSG00000215022	ncRNA_intronic	ENST00000606150;ENST00000612479	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:176,0,183
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6	21602321	21602321	T	C	56.74	PASS	ENSG00000220771	ncRNA_exonic	ENST00000404566	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	21607147	21607147	G	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000404566;ENST00000606336	dist=4764;dist=57625	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	21608748	21608748	C	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000404566;ENST00000606336	dist=6365;dist=56024	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	21809157	21809157	A	G	97.28	PASS	ENSG00000272168	ncRNA_intronic	ENST00000606336;ENST00000606851;ENST00000607048	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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6	21975457	21975457	C	A	21.77	PASS	ENSG00000272168	ncRNA_intronic	ENST00000444265;ENST00000606851;ENST00000607048	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	26538040	26538040	T	C	44.74	PASS	.	upstream	ENST00000377575	dist=365	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
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6	26871937	26871937	T	G	652.77	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_intronic	ENST00000479900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.36;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:681,57,0
6	26872166	26872166	C	T	647.77	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_exonic	ENST00000479900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.49;SOR=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:676,51,0
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6	26872893	26872893	A	G	472.77	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_intronic	ENST00000479900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.74;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
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6	26874612	26874612	G	A	263.8	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_intronic	ENST00000479900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.45;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
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6	26876881	26876881	T	C	768.77	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_intronic	ENST00000479900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.21;SOR=2.636	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:797,63,0
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6	26877254	26877254	A	G	635.77	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_intronic	ENST00000479900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.37;SOR=2.712	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:664,51,0
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6	26883430	26883430	G	C	1596.77	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_exonic	ENST00000463434;ENST00000479900;ENST00000492832	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.89;SOR=2.147	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1625,129,0
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6	26909473	26909473	T	A	21.77	PASS	ENSG00000241549	ncRNA_intronic	ENST00000463434;ENST00000479900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	27717309	27717309	A	G	33.77	PASS	.	intergenic	ENST00000628328;ENST00000407924	dist=7087;dist=19691	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.981;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,188
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6	29743054	29743054	G	A	36.77	PASS	ENSG00000273340,ENSG00000214922	ncRNA_intronic	ENST00000399247;ENST00000458236;ENST00000510438	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.13;ReadPosRankSum=0;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,149
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6	29743557	29743557	C	T	30.77	PASS	ENSG00000273340,ENSG00000214922	ncRNA_intronic	ENST00000399247;ENST00000458236;ENST00000510438	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:59,0,72
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6	29745496	29745496	G	T	183.77	PASS	ENSG00000273340,ENSG00000214922	ncRNA_exonic	ENST00000458236;ENST00000510438	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.506;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:212,0,249
6	29745688	29745688	T	C	99.77	PASS	ENSG00000214922,ENSG00000273340	ncRNA_exonic	ENST00000458236;ENST00000510438	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:128,0,235
6	29745991	29745991	A	G	46.77	PASS	ENSG00000214922,ENSG00000273340	ncRNA_intronic	ENST00000399247;ENST00000458236;ENST00000510438	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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6	34712154	34712154	A	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000606971;ENST00000334441	dist=14684;dist=3459	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	34724240	34724240	A	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000334441;ENST00000408001	dist=8300;dist=19936	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	34725361	34725361	A	G	52.77	PASS	.	intergenic	ENST00000334441;ENST00000408001	dist=9421;dist=18815	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
6	34725371	34725371	A	G	52.77	PASS	.	intergenic	ENST00000334441;ENST00000408001	dist=9431;dist=18805	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
6	34726183	34726183	C	G	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000334441;ENST00000408001	dist=10243;dist=17993	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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6	57950555	57950555	C	T	290.77	PASS	ENSG00000215190	ncRNA_intronic	ENST00000399751;ENST00000418368;ENST00000418765;ENST00000450081	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.3;ReadPosRankSum=0;SOR=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:319,0,280
6	57950652	57950652	G	A	135.77	PASS	ENSG00000215190	ncRNA_intronic	ENST00000399751;ENST00000418368;ENST00000418765;ENST00000450081	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:164,0,304
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6	71374294	71374294	C	T	186.84	PASS	ENSG00000279312	ncRNA_exonic	ENST00000625013	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.14;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:215,18,0
6	71374709	71374709	T	C	148.9	PASS	ENSG00000279312	ncRNA_exonic	ENST00000625013	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.78;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:177,15,0
6	71376235	71376235	A	T	139.03	PASS	ENSG00000269966,ENSG00000233237	ncRNA_intronic	ENST00000413945;ENST00000436803;ENST00000602823	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	71415684	71415684	A	T	56.74	PASS	ENSG00000233237	ncRNA_exonic	ENST00000426635	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	72610682	72610682	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000428697;ENST00000342056	dist=11048;dist=11110	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	72614975	72614975	T	C	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000428697;ENST00000342056	dist=15341;dist=6817	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	125760579	125760579	G	T	4183.77	PASS	ENSG00000135547	UTR3	ENST00000368364;ENST00000368365	ENST00000368364:c.*777G>T;ENST00000368365:c.*777G>T	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.24;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:4212,327,0
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6	125896707	125896707	A	G	46.77	PASS	ENSG00000111912	intronic	ENST00000229634;ENST00000368357;ENST00000392477	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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6	125927450	125927450	G	A	64.77	PASS	ENSG00000111912	intronic	ENST00000229634;ENST00000368357;ENST00000392477;ENST00000438495;ENST00000444128	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:93:93,0,343
6	125931487	125931487	T	C	75.77	PASS	ENSG00000111912	UTR3	ENST00000392477	ENST00000392477:c.*2716T>C	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,146
6	125979431	125979431	G	A	1405.77	PASS	ENSG00000111911	UTR3	ENST00000229633	ENST00000229633:c.*1755G>A	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.998;SOR=1.06	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,56:214:99:1434,0,5706
6	126078155	126078155	C	G	305.78	PASS	.	intergenic	ENST00000479748;ENST00000444229	dist=38879;dist=99038	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=24.75;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
6	126123538	126123538	A	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000479748;ENST00000444229	dist=84262;dist=53655	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	149825713	149825713	T	C	26.78	PASS	ENSG00000231760	ncRNA_intronic	ENST00000628047	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.275	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:55:55,0,278
6	149825831	149825831	T	C	163.77	PASS	ENSG00000231760	ncRNA_intronic	ENST00000628047	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:192,0,59
6	149838917	149838917	G	A	56.74	PASS	ENSG00000120256	intronic	ENST00000239367	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	149839298	149839298	A	G	33.77	PASS	ENSG00000120256	intronic	ENST00000239367	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:62,0,33
6	149863746	149863746	G	C	509.77	PASS	ENSG00000268592,ENSG00000120256	exonic	ENST00000239367;ENST00000367368	.	missense SNV	ENSG00000120256:ENST00000239367:exon1:c.C275G:p.P92R,ENSG00000120256:ENST00000367368:exon1:c.C275G:p.P92R	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,18:38:99:538,0,687
6	149864373	149864373	T	A	89.78	PASS	ENSG00000268592	ncRNA_exonic	ENST00000606915	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:118,0,27
6	149889964	149889964	T	C	56.74	PASS	ENSG00000223701,ENSG00000268592,ENSG00000164520	exonic	ENST00000357183;ENST00000367363;ENST00000529948;ENST00000532335	.	synonymous SNV	ENSG00000164520:ENST00000357183:exon2:c.A267G:p.E89E,ENSG00000164520:ENST00000367363:exon2:c.A159G:p.E53E,ENSG00000164520:ENST00000529948:exon2:c.A267G:p.E89E,ENSG00000164520:ENST00000532335:exon3:c.A267G:p.E89E	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	149894733	149894733	T	C	21.77	PASS	ENSG00000268592,ENSG00000223701,ENSG00000164520	ncRNA_intronic	ENST00000446954;ENST00000605899;ENST00000606915	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	149904882	149904882	G	A	42.77	PASS	ENSG00000216906	ncRNA_exonic	ENST00000407115	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
6	149905356	149905356	C	T	46.77	PASS	ENSG00000216906	ncRNA_exonic	ENST00000407115	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
6	149942050	149942050	A	C	117.77	PASS	ENSG00000131015	UTR5	ENST00000367351	ENST00000367351:c.-23A>C	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:146,0,104
6	149946391	149946391	A	C	30.77	PASS	ENSG00000131015	exonic	ENST00000367351	.	synonymous SNV	ENSG00000131015:ENST00000367351:exon3:c.A369C:p.A123A	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.85;ReadPosRankSum=0;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,203
6	149972459	149972459	T	C	21.77	PASS	ENSG00000111981	UTR3	ENST00000229708	ENST00000229708:c.*1113T>C	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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6	150025396	150025396	T	C	63.28	PASS	ENSG00000155918	exonic	ENST00000286380;ENST00000367341	.	missense SNV	ENSG00000155918:ENST00000286380:exon1:c.A76G:p.R26G,ENSG00000155918:ENST00000367341:exon1:c.A76G:p.R26G	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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6	150061652	150061652	G	C	176.84	PASS	.	intergenic	ENST00000392260;ENST00000367339	dist=18299;dist=1498	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.47;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:205,18,0
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6	150062077	150062077	T	C	236.78	PASS	.	intergenic	ENST00000392260;ENST00000367339	dist=18724;dist=1073	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.31;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:26:265,26,0
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6	150062185	150062185	C	T	235.84	PASS	.	downstream	ENST00000367339	dist=965	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.76;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
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6	150800779	150800779	G	A	225.77	PASS	ENSG00000120278	exonic	ENST00000358517;ENST00000367328;ENST00000475490	.	synonymous SNV	ENSG00000120278:ENST00000475490:exon4:c.G231A:p.E77E,ENSG00000120278:ENST00000358517:exon6:c.G690A:p.E230E,ENSG00000120278:ENST00000367328:exon7:c.G690A:p.E230E	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.86;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.13;ReadPosRankSum=0;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:254,0,167
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6	150831520	150831520	T	C	96.77	PASS	ENSG00000120278	exonic	ENST00000358517;ENST00000367328	.	synonymous SNV	ENSG00000120278:ENST00000358517:exon15:c.T2409C:p.T803T,ENSG00000120278:ENST00000367328:exon16:c.T2409C:p.T803T	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:125,0,341
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6	160927162	160927162	A	C	152.03	PASS	ENSG00000233342	ncRNA_exonic	ENST00000420601	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=36.06;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
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6	165938237	165938237	C	T	46.77	PASS	ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
6	165939816	165939816	T	A	3696.77	PASS	ENSG00000223414	ncRNA_exonic	ENST00000455853	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=3.77;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.85;ReadPosRankSum=-2.089;SOR=1.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,112:143:99:3725,0,712
6	165940455	165940455	G	A	3528.77	PASS	ENSG00000223414	ncRNA_exonic	ENST00000455853	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.14;ReadPosRankSum=1.355;SOR=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,103:130:99:3557,0,669
6	165941074	165941074	C	T	168.9	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.78;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
6	165941396	165941396	A	C	263.77	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:292,0,140
6	165941594	165941594	C	T	401.53	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=30.89;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:3:428,0,3
6	165941791	165941791	T	C	69.77	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.601;SOR=2.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,177
6	165942199	165942199	G	A	207.82	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:19:236,0,19
6	165942349	165942349	A	G	222.84	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.77;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
6	165942716	165942716	A	G	128.78	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.46;ReadPosRankSum=0;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:157,0,24
6	165943953	165943953	C	T	253.77	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:48:282,0,48
6	165944060	165944060	T	C	23.79	QD	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.37;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.339;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:52:52,0,341
6	165944074	165944074	G	A	147.77	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=1.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:176,0,149
6	165944163	165944163	C	G	81.77	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.35;ReadPosRankSum=0;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:110,0,68
6	165944496	165944496	C	A	324.96	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.66;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:5:352,0,5
6	165944840	165944840	G	A	50.77	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=0;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
6	165945286	165945286	C	T	116.78	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.46;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:145,0,24
6	165947227	165947227	A	G	271.77	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.819;SOR=2.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:300,0,384
6	165947231	165947231	G	T	271.77	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:300,0,384
6	165947563	165947563	G	A	311.77	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=2;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.98;ReadPosRankSum=1.456;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:55:340,0,55
6	165947937	165947937	T	A	212.77	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.545;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:241,0,211
6	165948116	165948116	T	G	117.77	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.368;SOR=2.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:146,0,104
6	165949157	165949157	G	A	479.77	PASS	ENSG00000223414	ncRNA_exonic	ENST00000584911	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:508,0,382
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6	165953021	165953021	A	G	139.03	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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6	165953333	165953333	G	T	40.77	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,76
6	165953418	165953418	C	G	40.77	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,191
6	165953941	165953941	G	A	139.03	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	165956623	165956623	A	T	305.78	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.58;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
6	165959144	165959144	T	A	97.28	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	165961603	165961603	A	G	355.77	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.27;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:384,30,0
6	165962092	165962092	T	C	146.9	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.38;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
6	165963337	165963337	T	C	85.28	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
6	165964127	165964127	T	C	56.74	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	165964757	165964757	C	G	222.84	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.57;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
6	165965992	165965992	A	G	56.74	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	165967673	165967673	T	C	180.9	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.14;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
6	165967972	165967972	G	A	112.9	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.58;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:141,15,0
6	165968117	165968117	G	C	97.28	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	165969867	165969867	A	G	134.9	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.98;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:163,15,0
6	165970074	165970074	C	T	222.84	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.39;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
6	165970401	165970401	G	C	180.9	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.67;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
6	165970813	165970813	A	T	105.03	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
6	165972400	165972400	C	A	97.28	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	165972744	165972744	T	A	298.78	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.2;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:327,27,0
6	165973641	165973641	A	C	313.78	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.86;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
6	165973799	165973799	A	G	97.28	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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6	165975130	165975130	A	G	305.78	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.41;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
6	165978336	165978336	A	C	56.74	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	165978503	165978503	T	C	97.28	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	165979559	165979559	C	T	56.74	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	165980029	165980029	G	A	105.03	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
6	165982048	165982048	C	T	139.03	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	165983119	165983119	A	T	146.9	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.38;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
6	165984927	165984927	T	A	229.8	PASS	ENSG00000223414,ENSG00000112541	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.83;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:258,21,0
6	165985125	165985125	T	C	237.78	PASS	ENSG00000112541,ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.72;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:266,24,0
6	165986604	165986604	G	C	210.84	PASS	ENSG00000223414	ncRNA_intronic	ENST00000444465;ENST00000455853;ENST00000581850;ENST00000584179;ENST00000584911	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.12;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
6	165988024	165988024	T	A	7597.77	PASS	ENSG00000281832,ENSG00000223414	ncRNA_exonic	ENST00000455853;ENST00000584911;ENST00000629776	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.33;SOR=4.559	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:191:99:7626,574,0
6	165996992	165996992	A	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000629776;ENST00000402643	dist=7377;dist=67299	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	166059337	166059337	C	A	71.03	PASS	.	intergenic	ENST00000629776;ENST00000402643	dist=69722;dist=4954	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=17.76;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:99,12,0
6	166064836	166064836	G	A	56.74	PASS	ENSG00000216624	ncRNA_exonic	ENST00000402643	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	166097301	166097301	G	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000402643;ENST00000456477	dist=32001;dist=2364	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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6	166114770	166114770	A	G	46.77	PASS	.	intergenic	ENST00000456477;ENST00000296946	dist=1497;dist=42886	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.35;ReadPosRankSum=0;SOR=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,235
6	166321072	166321072	T	C	45.77	PASS	ENSG00000198818	intronic	ENST00000361731	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=2.69;ReadPosRankSum=2.715;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:74:74,0,499
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6	166977724	166977724	A	G	33.77	PASS	ENSG00000227598	ncRNA_intronic	ENST00000444102	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.303;SOR=2.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,176
6	166979034	166979034	T	C	49.77	PASS	ENSG00000227598	ncRNA_intronic	ENST00000444102	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,134
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6	167017135	167017135	A	G	52.77	PASS	ENSG00000272980	ncRNA_intronic	ENST00000609590	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:81,0,75
6	167018341	167018341	T	C	56.74	PASS	ENSG00000272980	ncRNA_intronic	ENST00000609590	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	167021118	167021118	A	G	43.77	PASS	ENSG00000272980	ncRNA_intronic	ENST00000609590	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:40:72,0,40
6	167021198	167021198	T	C	40.77	PASS	ENSG00000272980	ncRNA_intronic	ENST00000609590	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,78
6	167027535	167027535	T	G	50.77	PASS	ENSG00000272980	ncRNA_intronic	ENST00000609590	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=0;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
6	167032078	167032078	C	A	180.9	PASS	ENSG00000272980	ncRNA_intronic	ENST00000609590	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.91;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
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6	167784914	167784914	C	T	291.77	PASS	ENSG00000146521	ncRNA_exonic	ENST00000495520	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.74;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.52;SOR=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:320,0,384
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6	169219592	169219592	G	A	50.77	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.15;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:79,0,30
6	169221041	169221041	T	C	47.77	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.645;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:76,0,69
6	169226735	169226735	C	T	143.84	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=23.97;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:172,18,0
6	169226942	169226942	A	G	59.74	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	169226950	169226950	A	T	59.74	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.26;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
6	169227854	169227854	G	A	62.74	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	169227863	169227863	T	C	62.74	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	169229688	169229688	G	A	932.77	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.92;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:961,69,0
6	169229766	169229766	G	C	63.77	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.66;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.8;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:92:92,0,267
6	169229815	169229815	G	C	97.28	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	169234714	169234714	C	T	139.03	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	169234915	169234915	G	A	56.74	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	169235110	169235110	T	G	85.28	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
6	169237361	169237361	G	A	21.8	QD	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.09;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.447;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,308
6	169237424	169237424	C	T	21.8	QD	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,309
6	169237606	169237606	T	A	162.78	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.13;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:191,0,24
6	169237877	169237877	C	T	105.03	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=26.26;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
6	169238117	169238117	C	T	56.74	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_intronic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	169239263	169239263	T	C	845.77	PASS	ENSG00000226445	ncRNA_exonic	ENST00000444188	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.32;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:874,81,0
6	169240434	169240434	C	T	145.77	PASS	ENSG00000186340	intronic	ENST00000366787;ENST00000617924	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.217;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:174,0,224
6	169340062	169340062	A	C	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000414044;ENST00000433388	dist=42103;dist=29936	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	169363536	169363536	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000414044;ENST00000433388	dist=65577;dist=6462	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	169385278	169385278	T	C	56.74	PASS	ENSG00000226194	ncRNA_intronic	ENST00000433388;ENST00000440168	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	169389770	169389770	C	T	48.28	PASS	.	intergenic	ENST00000433388;ENST00000607876	dist=1385;dist=36650	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=16.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:76,9,0
6	169426971	169426971	A	G	94.77	PASS	ENSG00000272848	ncRNA_exonic	ENST00000607876	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=23.69;ReadPosRankSum=-1.15;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:83:123,0,83
6	169428015	169428015	G	C	56.74	PASS	.	upstream	ENST00000607876	dist=946	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	169428820	169428820	C	T	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000607876;ENST00000448612	dist=1751;dist=28392	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	169433726	169433726	G	A	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000607876;ENST00000448612	dist=6657;dist=23486	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
6	169502440	169502440	T	G	63.28	PASS	ENSG00000184465	intronic	ENST00000423258;ENST00000448612	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
6	169558402	169558402	G	C	472.77	PASS	ENSG00000184465	intronic	ENST00000423258;ENST00000448612	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.08;SOR=5.136	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
6	169559252	169559252	A	G	753.77	PASS	ENSG00000184465	intronic	ENST00000423258;ENST00000448612	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.38;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:782,57,0
6	169559274	169559274	T	C	836.77	PASS	ENSG00000184465	intronic	ENST00000423258;ENST00000448612	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=20.31;SOR=1.828	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:865,63,0
6	169559544	169559544	G	A	936.77	PASS	ENSG00000184465	intronic	ENST00000423258;ENST00000448612	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.46;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:965,84,0
6	169559699	169559699	G	A	72.77	PASS	ENSG00000184465	intronic	ENST00000423258;ENST00000448612	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.77	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:101,0,603
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7	1168917	1168917	C	A	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000423008;ENST00000316333	dist=3650;dist=63990	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	1169074	1169074	C	G	97.28	PASS	.	intergenic	ENST00000423008;ENST00000316333	dist=3807;dist=63833	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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7	1169253	1169253	A	G	92.28	PASS	.	intergenic	ENST00000423008;ENST00000316333	dist=3986;dist=63654	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.77;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:120,9,0
7	1169332	1169332	G	A	65.28	PASS	.	intergenic	ENST00000423008;ENST00000316333	dist=4065;dist=63575	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.76;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
7	1169377	1169377	A	G	276.8	PASS	.	intergenic	ENST00000423008;ENST00000316333	dist=4110;dist=63530	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=35.35;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
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7	27130964	27130964	C	T	146.9	PASS	ENSG00000253552,ENSG00000273433,ENSG00000105997,ENSG00000254369	ncRNA_intronic	ENST00000467897;ENST00000518848;ENST00000521159	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.38;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
7	27131087	27131087	G	A	430.77	PASS	ENSG00000254369,ENSG00000253552,ENSG00000273433,ENSG00000105997	ncRNA_intronic	ENST00000467897;ENST00000518848;ENST00000521159	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.18;SOR=3.442	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
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7	27132753	27132753	A	G	34.77	PASS	ENSG00000254369,ENSG00000105997,ENSG00000253552,ENSG00000273433	ncRNA_intronic	ENST00000467897;ENST00000518848;ENST00000521159	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-2.2;ClippingRankSum=0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,489
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7	27156450	27156450	A	C	347.78	PASS	ENSG00000122592	exonic	ENST00000242159	.	synonymous SNV	ENSG00000122592:ENST00000242159:exon1:c.T96G:p.A32A	AC=2;AF=1;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.05;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
7	27156494	27156494	C	T	185.84	PASS	ENSG00000122592	exonic	ENST00000242159;ENST00000519842	.	missense SNV	ENSG00000122592:ENST00000242159:exon1:c.G52A:p.A18T,ENSG00000122592:ENST00000519842:exon3:c.G52A:p.A18T	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.97;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:214,18,0
7	27160637	27160637	G	C	112.9	PASS	.	intergenic	ENST00000602610;ENST00000343483	dist=1661;dist=1798	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=22.58;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:141,15,0
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7	29684647	29684647	G	A	21.77	PASS	ENSG00000227855	ncRNA_exonic	ENST00000602965	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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7	32635322	32635322	A	C	56.74	PASS	ENSG00000229358	ncRNA_exonic	ENST00000417811	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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7	32685100	32685100	A	C	123.78	PASS	ENSG00000229358	ncRNA_intronic	ENST00000417811	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:152,0,27
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7	32756511	32756511	G	T	168.9	PASS	ENSG00000229358	ncRNA_intronic	ENST00000417811	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=33.78;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
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7	43982073	43982073	T	G	263.8	PASS	ENSG00000214783,ENSG00000273432	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=31.82;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
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7	43982641	43982641	T	C	81.77	PASS	ENSG00000214783,ENSG00000273432	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,114
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7	43992424	43992424	T	C	63.28	PASS	ENSG00000273432,ENSG00000214783	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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7	43992743	43992743	T	C	40.77	PASS	ENSG00000214783,ENSG00000273432	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,118
7	43993011	43993011	A	G	61.77	PASS	ENSG00000273432,ENSG00000214783	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.533;SOR=3.229	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:90:90,0,214
7	43993034	43993034	C	T	102.77	PASS	ENSG00000214783,ENSG00000273432	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.473;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,264
7	43993221	43993221	G	C	113.77	PASS	ENSG00000214783,ENSG00000273432	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:142,0,183
7	43993246	43993246	A	T	165.94	PASS	ENSG00000273432,ENSG00000214783	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=23.71;ReadPosRankSum=1.465;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:14:194,0,14
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7	43994729	43994729	T	C	63.28	PASS	ENSG00000273432,ENSG00000214783	ncRNA_intronic	ENST00000422304;ENST00000427076;ENST00000454572	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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7	65077337	65077337	T	C	59.74	PASS	ENSG00000227113	ncRNA_intronic	ENST00000414799	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=29.87;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	65077432	65077432	A	T	97.28	PASS	ENSG00000227113	ncRNA_intronic	ENST00000414799	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	65078108	65078108	C	T	63.28	PASS	ENSG00000227113	ncRNA_intronic	ENST00000414799	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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7	65084103	65084103	A	G	55.74	PASS	ENSG00000226002	ncRNA_exonic	ENST00000441415	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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7	65770418	65770418	T	C	56.74	PASS	ENSG00000272693	ncRNA_intronic	ENST00000633579	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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7	66542344	66542344	T	C	42.77	PASS	ENSG00000229180,ENSG00000234500	ncRNA_exonic	ENST00000449307;ENST00000625310	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
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7	66542525	66542525	T	C	79.77	PASS	ENSG00000229180,ENSG00000234500	ncRNA_exonic	ENST00000449307;ENST00000625310	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:75:108,0,75
7	66542632	66542632	T	C	34.77	PASS	ENSG00000234500	ncRNA_intronic	ENST00000448776	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.68;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.068;SOR=2.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,120
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7	73282574	73282574	C	T	84.77	PASS	.	intergenic	ENST00000449689;ENST00000380760	dist=2455;dist=10923	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=21.19;ReadPosRankSum=1.15;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
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7	76624707	76624707	A	G	21.77	PASS	ENSG00000205485,ENSG00000146707	ncRNA_intronic	ENST00000418663;ENST00000450661	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
7	76625493	76625493	C	T	37.77	PASS	ENSG00000205485,ENSG00000146707	ncRNA_intronic	ENST00000418663;ENST00000450661	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.31;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.282;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,117
7	76626135	76626135	G	A	1665.77	PASS	ENSG00000205485,ENSG00000146707	ncRNA_exonic	ENST00000418663;ENST00000450661	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.409;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,50:102:99:1694,0,1705
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7	76968036	76968036	A	G	63.28	PASS	.	upstream;downstream	ENST00000421583;ENST00000429043	dist=161;dist=161	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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7	76972446	76972446	G	C	21.77	PASS	.	downstream	ENST00000434531	dist=233	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
7	76978621	76978621	C	T	731.77	PASS	ENSG00000186704	ncRNA_exonic	ENST00000425797	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=27.92;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:760,57,0
7	76978826	76978826	C	T	989.77	PASS	ENSG00000186704	ncRNA_exonic	ENST00000425797	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.84;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1018,78,0
7	76980627	76980627	T	C	774.77	PASS	ENSG00000186704	ncRNA_exonic	ENST00000425797	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=35.52;SOR=1.127	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:803,60,0
7	76980982	76980982	A	G	468.77	PASS	ENSG00000186704,ENSG00000265479	ncRNA_exonic	ENST00000425797;ENST00000584900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.36;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:497,39,0
7	76981029	76981029	C	T	247.78	PASS	ENSG00000265479,ENSG00000186704	ncRNA_exonic	ENST00000425797;ENST00000584900	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.1;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:276,24,0
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8	8146133	8146133	A	G	49.77	PASS	.	intergenic	ENST00000520330;ENST00000509557	dist=29184;dist=8175	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=16.59;ReadPosRankSum=0;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
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8	8239835	8239835	A	G	33.77	PASS	ENSG00000173295	ncRNA_exonic	ENST00000588728	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,188
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9	6653918	6653918	A	G	97.28	PASS	ENSG00000236924	ncRNA_intronic	ENST00000413145	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=32.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	6654050	6654050	G	A	73.28	PASS	ENSG00000236924	ncRNA_intronic	ENST00000413145	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=24.43;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:101,9,0
9	6656721	6656721	G	A	56.74	PASS	ENSG00000236924	ncRNA_intronic	ENST00000413145	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	6658080	6658080	A	G	40.78	PASS	ENSG00000236924	ncRNA_intronic	ENST00000413145	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:69,0,27
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9	6664753	6664753	G	C	46.77	PASS	ENSG00000236924	ncRNA_intronic	ENST00000413145	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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9	6665469	6665469	G	T	63.28	PASS	ENSG00000236924	ncRNA_intronic	ENST00000413145	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
9	6666448	6666448	A	G	46.77	PASS	ENSG00000236924	ncRNA_intronic	ENST00000413145	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=15.59;ReadPosRankSum=0;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
9	6677793	6677793	T	C	153.84	PASS	.	intergenic	ENST00000427308;ENST00000412339	dist=2179;dist=26678	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=25.64;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:182,18,0
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9	6678256	6678256	C	T	56.74	PASS	.	intergenic	ENST00000427308;ENST00000412339	dist=2642;dist=26215	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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9	6683035	6683035	A	G	43.77	PASS	.	intergenic	ENST00000427308;ENST00000412339	dist=7421;dist=21436	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.383;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:37:72,0,37
9	6683108	6683108	A	G	42.77	PASS	.	intergenic	ENST00000427308;ENST00000412339	dist=7494;dist=21363	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.431;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
9	6684201	6684201	A	G	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000427308;ENST00000412339	dist=8587;dist=20270	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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9	6689345	6689345	G	A	159.77	PASS	.	intergenic	ENST00000427308;ENST00000412339	dist=13731;dist=15126	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:188,0,139
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9	6718102	6718102	A	G	640.77	PASS	ENSG00000225489	ncRNA_exonic	ENST00000452643;ENST00000615168	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=31.21;ReadPosRankSum=2.151;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,16:17:32:669,0,32
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9	6718375	6718375	G	C	663.77	PASS	ENSG00000225489	ncRNA_exonic	ENST00000452643;ENST00000615168	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=30.17;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:692,66,0
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9	6721438	6721438	G	A	21.77	PASS	ENSG00000274527,ENSG00000225489	ncRNA_intronic	ENST00000451142;ENST00000452643;ENST00000615168	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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9	15055568	15055568	C	A	56.74	PASS	ENSG00000234297	ncRNA_exonic	ENST00000422292	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=28.37;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	15055609	15055609	G	A	139.03	PASS	ENSG00000234297	ncRNA_exonic	ENST00000422292	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=34.76;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
9	15129476	15129476	G	A	21.77	PASS	ENSG00000232000	ncRNA_intronic	ENST00000609203	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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9	38555616	38555616	T	C	116.77	PASS	ENSG00000272904	ncRNA_intronic	ENST00000567428	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.85	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:145,0,145
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9	41264910	41264910	G	T	21.77	PASS	.	intergenic	ENST00000612104;ENST00000633881	dist=27353;dist=5006	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=10.88;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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9	65289850	65289850	C	A	280.77	PASS	ENSG00000204778	ncRNA_exonic	ENST00000445695	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.66;SOR=0.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:38:309,0,38
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9	65304656	65304656	A	T	63.28	PASS	ENSG00000204778	ncRNA_intronic	ENST00000445695	.	.	.	AC=2;AF=1;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=2;MLEAF=1;MQ=60;QD=21.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
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9	68230581	68230581	C	T	136.77	PASS	.	intergenic	ENST00000425587;ENST00000360171	dist=1269;dist=10900	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=27.35;ReadPosRankSum=0;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:68:165,0,68
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X	74197090	74197090	T	C	82.77	QD	ENSG00000230590	ncRNA_intronic	ENST00000602420;ENST00000602812;ENST00000603672	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=5.939;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.323;SOR=1.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,13:112:99:111,0,3397
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X	74222494	74222494	T	C	42.77	PASS	ENSG00000230590,ENSG00000271430	ncRNA_intronic	ENST00000602420;ENST00000602812;ENST00000603037;ENST00000603672	.	.	.	AC=1;AF=0.5;AN=2;BaseQRankSum=0;ClippingRankSum=0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0;MLEAC=1;MLEAF=0.5;MQ=60;MQRankSum=0;QD=10.69;ReadPosRankSum=0;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,71
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